Геномный профиль карциномы околощитовидной железы на основе полногеномного секвенирования

Карцинома околощитовидной железы (PC) — редкое злокачественное эндокринное новообразование с неблагоприятными исходами. Хотя у некоторых пациентов выявлены мутации, включая CDC73, для уточнения молекулярных механизмов PC необходимы дополнительные масштабные данные. Полногеномное секвенирование (WGS) выполнено на замороженных образцах 23 пациентов с PC. Периферические лейкоциты были собраны у 14 пациентов и использованы в качестве контроля. Были выявлены соматические и герминальные изменения генов, аномалии числа копий и структурные варианты. Инактивирующие мутации CDC73 обнаружены у 39,1% пациентов, однако выявлена только одна герминальная инактивирующая мутация. Другие связанные с раком мутации, выявленные более чем в одном случае, включали MAF (2/23), NEB (6/23), NCOR1 (2/23), TTK (2/23), GRIN3A (4/23), TRIO (2/23), MAP1B (2/23), TJP2 (2/23) и FAM20A (2/23). В семи образцах дикого типа по CDC73 мутировавшие гены были обогащены в путях, связанных с презентацией антигена, отторжением аллотрансплантата или аутоиммунными заболеваниями. У пациентов с рецидивом рака (P = .006) и мутациями CDC73 (P = .022) выявлено больше вариантов числа копий, чем у пациентов без этих признаков. Потеря PIK3CA обнаружена в одном образце, который также содержал мутацию CDC73. Изменения генов в пути PI3K/AKT/mTOR выявлены в 78,3% (18/23) опухолей. Наиболее распространенными мутациями, предрасполагающими к раку, были PDE4DIP (15/23), MAP3K1 (13/23) и CDC42EP1 (10/23). В заключение, путь PI3K/AKT/mTOR может играть ключевую роль в PC. Мутация CDC73 коррелировала с повышенной мутационной нагрузкой и рецидивированием опухоли. У пациентов с PC дикого типа по CDC73 выявлялись мутации, связанные с презентацией антигена и аутоиммунными заболеваниями. Молекулярная классификация на основе статуса мутации CDC73 может помочь в планировании наблюдения и терапии пациентов с PC.