Таргетное секвенирование с длинными чтениями позволяет всесторонне анализировать генетический и эпигенетический ландшафт наследственных миопатий
Targeted long-read sequencing enables comprehensive analysis of the genetic and epigenetic landscape of inherited myopathies
2026-07-04
SCID: 54.1/xwc3ba2m
Discuss with AI
эпигенетические сигнатурынаследственные миопатииповторные экспансииструктурные вариантытаргетный длинночит-совое секвенирование
Figures from the paper
Abstract (AI)
Генетические варианты, вызывающие наследственные миопатии, сильно различаются по типу, размеру и последовательностному контексту и включают мелкие последовательностные варианты, крупные структурные варианты, расширения повторов и более сложные события, такие как контаркция макросателлита D4Z4 и гипометилирование, вызывающие фасциоскулопереднюю мышечную дистрофию. Многие из этих вариантов трудно охарактеризовать с помощью секвенирования следующего поколения и других более старых молекулярных технологий. Для решения этой задачи мы разработали таргетный анализ методом секвенирования с длинными чтениями и биоинформатическую аналитическую платформу, охватывающие полный набор генов, вариантов и эпигенетических сигнатур, в настоящее время вовлечённых в наследственные миопатии. Применяя этот подход к когортe пациентов с миопатиями, мы демонстрируем аналитическую валидность метода и его повышенную точность и разрешающую способность по сравнению с существующими методами. Наш анализ привёл к новым генетическим диагнозам у 35,5% (11/31) пациентов, оставшихся без диагноза после стандартного клинического генетического тестирования. Эта методология представляет собой единый упрощённый тест для всесторонней генетической и эпигенетической характеристики наследственных миопатий.
Key Findings
1
Разработан таргетный метод длинного секвенирования и биоинформатический фреймворк для захвата генов, вариантов и эпигенетических сигнатур, связанных с наследственными миопатиями.
2
При применении к когорте пациентов с миопатиями метод показал аналитическую валидность и повышенную точность и разрешающую способность по сравнению с существующими методами.
3
Метод способен характеризовать широкий спектр типов вариантов, трудных для короткого NGS, включая мелкие варианты, крупные структурные варианты, экспансии повторов и сложные события, такие как сокращение макросателлита D4Z4 и гипометилирование.
4
Метод обеспечил новые генетические диагнозы у 35,5% (11/31) пациентов, оставшихся недиагностированными после стандартного клинического генетического тестирования.
5
Единый оптимизированный тест позволяет всесторонне генетически и эпигенетически характеризовать наследственные миопатии в рамках одного рабочего процесса.
Research Object
Целевая длинночтующая секвенирующая методика и биоинформатический аналитический фреймворк для генов, вовлечённых в наследственные миопатии
Research Subject
Комплексное выявление и характеристика генетических вариантов (мелкие варианты, крупные структурные варианты, экспансии повторов, сложные события) и эпигенетических сигнатур (например, метилирование/гипометилирование D4Z4), лежащих в основе наследственных миопатий, а также аналитическая валидность методики и диагностическая эффективность по сравнению со стандартными методами
Publication Details
Publication Date
2026-07-04
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
0
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest