Архитектура хроматина у дрозофилы: жить без петлеобразования CTCF/кохезина?

Chromatin Architecture in the Fly: Living without CTCF/Cohesin Loop Extrusion?
Robert A. White, Nicholas E. Matthews
2019-07-01

экструзия петель CTCF/cohesinорганизация генома Drosophilaразбиение состояний хроматинатопологически ассоциированные домены (TADs)
Организация генома в топологически ассоциированные домены (TAD) представляется фундаментальным процессом, происходящим у широкого круга эукариотических организмов, и, вероятно, играющим важную роль в создании архитектурной основы для регуляции генов. Первые исследования подчеркнули замечательные параллели в организации TAD у таких разных организмов, как Drosophila и млекопитающие. Однако в то время как фактор связывания CCCTC (CTCF) и коhezин-опосредованное выдавливание петель (loop extrusion) становятся ключевым механизмом формирования топологических доменов у млекопитающих, организация генома у Drosophila по-видимому в основном зависит от разбиения на домены состояния хроматина. Обсуждается недавняя работа, указывающая на фундаментально сохранённую роль состояния хроматина в формировании архитектуры доменов, и рассматриваются выводы о организации генома, полученные в последних исследованиях на Drosophila.
1
Организация генома у Drosophila, по-видимому, в первую очередь зависит от разбиения на домены состояния хроматина, а не от экструзии петель CTCF/кохезином.
2
У млекопитающих фактически ключевым механизмом формирования топологических доменов является экструзия петель, опосредованная CTCF/кохезином.
3
Результаты недавних исследований Drosophila указывают на альтернативные механизмы формирования TAD в мухах вместо экструзии петель.
4
Недавние исследования подтверждают консервативную, фундаментальную роль состояния хроматина в формировании архитектуры доменов между видами.
5
Топологически ассоциированные домены (TAD) являются фундаментальной, консервативной особенностью организации генома у различных эукариот, включая Drosophila и млекопитающих.

Архитектура хроматина / организация генома у Drosophila (мухи)

Роли и механизмы, формирующие топологически ассоциированные домены (TAD) у Drosophila, в частности зависимость от партитирования состояний хроматина по сравнению с экструзией петель CTCF/cohesin

Publication Details
Publication Date
2019-07-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Robert A. White
Nicholas E. Matthews
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%