Новая модель деградации древней ДНК на основе палеогеномного метаанализа

Сохранение ДНК на археологических и палеонтологических временных масштабах в различных условиях привело к стремительному развитию палеогеномных исследований, однако динамика деградации ДНК по-прежнему изучена недостаточно. Мы проанализировали 185 палеогеномных наборов данных и сопоставили сохранность ДНК с параметрами окружающей среды и возрастом образцов. Мы обнаружили, что дезаминирование цитозина подчиняется традиционной термической модели зависимости возраста, однако не выявили корреляции между фрагментацией ДНК и возрастом образцов в исследованных временных интервалах, даже с учетом факторов окружающей среды. Мы предлагаем модель деградации древней ДНК, согласно которой фрагментация быстро достигает порогового уровня, после чего ее скорость снижается. Наблюдаемая со временем утрата ДНК во многих случаях может быть обусловлена процессом объемной диффузии, что подчеркивает важность тканей и условий окружающей среды, формирующих практически замкнутые системы для сохранения ДНК. Эта модель деградации ДНК в значительной степени основана на образцах костей млекопитающих вследствие доступности опубликованных геномных наборов данных. Дальнейшее совершенствование модели с учетом разнообразных биологических систем и типов тканей позволит углубить наше понимание динамики распада древней ДНК.