Глобальный эпистаз возникает из общей модели сложного признака

Global epistasis emerges from a generic model of a complex trait
Gautam Reddy, Michael M. Desai
2020-06-14

распределение эффектов приспособленностимодель ландшафта приспособленностиглобальный эпистазмикроскопический эпистазфенотипическая эволюция
Эпистаз между мутациями может сделать адаптацию зависимой от эволюционной истории. Однако, несмотря на широко распространённый микроскопический эпистаз между участвующими мутациями, эксперименты по эволюции микроорганизмов демонстрируют согласованные закономерности повышения приспособленности в повторных линиях. Недавние исследования показывают, что эта согласованность частично обусловлена глобальными закономерностями эпистаза убывающей отдачи и возрастающих издержек, из-за которых мутации систематически оказываются менее благоприятными (или более вредными) на генетических фонах с более высокой приспособленностью. Однако механистическая основа этого глобального эпистаза остаётся неизвестной. Здесь мы показываем, что эпистаз убывающей отдачи и возрастающих издержек закономерно возникает как следствие повсеместного микроскопического эпистаза. Наша модель предсказывает специфическое количественное соотношение между величиной глобального эпистаза и стохастическими эффектами микроскопического эпистаза, что мы подтверждаем повторным анализом существующих данных. Кроме того, мы показываем, что при широком распространении эпистаза распределение эффектов на приспособленность принимает универсальную форму, и предлагаем новую модель ландшафта приспособленности, демонстрирующую, как эволюция фенотипа может быть воспроизводимой несмотря на стохастичность на уровне последовательности.
1
Новая модель ландшафта приспособленности объясняет, как фенотипическая эволюция может оставаться воспроизводимой несмотря на случайность на уровне последовательностей.
2
Эпистаз с убывающей отдачей и возрастающими издержками возникает закономерно вследствие широко распространённого микроскопического эпистаза.
3
Предложенный подход даёт механистическое объяснение согласованного увеличения приспособленности в независимых линиях микробной эволюции несмотря на повсеместный эпистаз между мутациями.
4
Модель предсказывает конкретную количественную связь между величиной глобального эпистаза и случайными эффектами микроскопического эпистаза; эта связь подтверждена повторным анализом существующих данных.
5
При широко распространённом эпистазе распределение эффектов приспособленности приобретает универсальную форму.

Глобальный эпистаз в адаптации микроорганизмов и ландшафтах приспособленности, формируемый широко распространённым микроскопическим эпистазом

Возникновение, количественная взаимосвязь и эволюционные последствия глобального эпистаза с убывающей отдачей и возрастающими издержками, включая его влияние на распределения эффектов приспособленности и воспроизводимость фенотипической эволюции

Publication Details
Publication Date
2020-06-14
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Gautam Reddy
Michael M. Desai
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%