BioSeq-BLM: платформа для анализа последовательностей ДНК, РНК и белков на основе биологических языковых моделей

BioSeq-BLM: a platform for analyzing DNA, RNA and protein sequences based on biological language models
Hongliang Li, Bin Liu, Yihe Pang
2021-09-09

BioSeq-BLMанализ последовательностей ДНКанализ последовательностей РНКбиологические языковые моделианализ белковых последовательностей
Для раскрытия смысла «книги жизни» в настоящем исследовании рассматриваются 155 биологических языковых моделей (BLM) для анализа последовательностей ДНК, РНК и белков, способных извлекать лингвистические свойства «книги жизни». Кроме того, эти BLM интегрированы в систему BioSeq-BLM, предназначенную для автоматического представления и анализа данных о последовательностях. Экспериментальные результаты показывают, что предикторы, созданные с помощью BioSeq-BLM, демонстрируют сопоставимую или явно более высокую производительность по сравнению с существующими передовыми предикторами, опубликованными в научной литературе. Это указывает на то, что BioSeq-BLM может предложить новые подходы к анализу биологических последовательностей на основе технологий обработки естественного языка и способствовать развитию этой важной области. Для того чтобы пользователи могли применять BioSeq-BLM в собственных экспериментах, были разработаны и выпущены соответствующие веб-сервер и автономный пакет, доступные для бесплатного использования по адресу http://bliulab.net/BioSeq-BLM/.
1
BioSeq-BLM выпущен в виде свободно доступных веб-сервера и автономного пакета для проведения экспериментов по анализу биологических последовательностей.
2
Предикторы, созданные с помощью BioSeq-BLM, демонстрируют сопоставимую, а в некоторых случаях явно более высокую производительность по сравнению с существующими передовыми предикторами.
3
Авторы разработали BioSeq-BLM для автоматического представления и анализа последовательностей ДНК, РНК и белков с использованием биологических языковых моделей.
4
В исследовании рассмотрены 155 биологических языковых моделей для анализа последовательностей ДНК, РНК и белков, извлекающих лингвистические свойства биологических последовательностей.

последовательности ДНК, РНК и белков

представление лингвистических свойств и автоматизированный анализ биологических последовательностей с использованием биологических языковых моделей

Publication Details
Publication Date
2021-09-09
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
267
Access Type
Author Information
Authors
Hongliang Li
Bin Liu
Yihe Pang
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%