BioSeq-BLM: платформа для анализа последовательностей ДНК, РНК и белков на основе биологических языковых моделей
BioSeq-BLM: a platform for analyzing DNA, RNA and protein sequences based on biological language models
2021-09-09
SCID: 54.1/zwzke4ah
Discuss with AI
BioSeq-BLMанализ последовательностей ДНКанализ последовательностей РНКбиологические языковые моделианализ белковых последовательностей
Figures from the paper
Abstract (AI)
Для раскрытия смысла «книги жизни» в настоящем исследовании рассматриваются 155 биологических языковых моделей (BLM) для анализа последовательностей ДНК, РНК и белков, способных извлекать лингвистические свойства «книги жизни». Кроме того, эти BLM интегрированы в систему BioSeq-BLM, предназначенную для автоматического представления и анализа данных о последовательностях. Экспериментальные результаты показывают, что предикторы, созданные с помощью BioSeq-BLM, демонстрируют сопоставимую или явно более высокую производительность по сравнению с существующими передовыми предикторами, опубликованными в научной литературе. Это указывает на то, что BioSeq-BLM может предложить новые подходы к анализу биологических последовательностей на основе технологий обработки естественного языка и способствовать развитию этой важной области. Для того чтобы пользователи могли применять BioSeq-BLM в собственных экспериментах, были разработаны и выпущены соответствующие веб-сервер и автономный пакет, доступные для бесплатного использования по адресу http://bliulab.net/BioSeq-BLM/.
Key Findings
1
BioSeq-BLM выпущен в виде свободно доступных веб-сервера и автономного пакета для проведения экспериментов по анализу биологических последовательностей.
2
Предикторы, созданные с помощью BioSeq-BLM, демонстрируют сопоставимую, а в некоторых случаях явно более высокую производительность по сравнению с существующими передовыми предикторами.
3
Авторы разработали BioSeq-BLM для автоматического представления и анализа последовательностей ДНК, РНК и белков с использованием биологических языковых моделей.
4
В исследовании рассмотрены 155 биологических языковых моделей для анализа последовательностей ДНК, РНК и белков, извлекающих лингвистические свойства биологических последовательностей.
Research Object
последовательности ДНК, РНК и белков
Research Subject
представление лингвистических свойств и автоматизированный анализ биологических последовательностей с использованием биологических языковых моделей
Publication Details
Publication Date
2021-09-09
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
267
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest