MISA-web: веб-сервер для предсказания микросателлитов
MISA-web: a web server for microsatellite prediction
2017-04-06
SCID: 54.1/4ak86n6e
Discuss with AI
формат GFF3MISA-webобнаружение составных микросателлитовмикросателлитные маркерыпредсказание микросателлитов
Figures from the paper
Abstract (AI)
ОБОСНОВАНИЕ: Микросателлиты представляют собой широко используемую систему маркеров в генетике растений и криминалистике. Разработка надежных микросателлитных маркеров на основе данных повторного секвенирования представляет собой сложную задачу. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы расширили MISA — вычислительный инструмент, предназначенный для разработки микросателлитных маркеров, — и реализовали его в виде веб-приложения. Мы усовершенствовали выявление сложных микросателлитов и добавили возможность отображения и экспорта результатов MISA в формате GFF3 для последующего анализа. ДОСТУПНОСТЬ И РЕАЛИЗАЦИЯ: Доступ к MISA-web можно получить по адресу http://misaweb.ipk-gatersleben.de/. На веб-сайте представлены учебные материалы, руководство пользователя и ссылки для загрузки исходного кода. КОНТАКТЫ: scholz@ipk-gatersleben.de.
Key Findings
1
MISA была расширена и переimplementedирована как веб-приложение для разработки микросателлитных маркеров из данных повторного секвенирования.
2
MISA-web улучшает обнаружение составных микросателлитов по сравнению с исходной функциональностью MISA.
3
MISA-web доступна онлайн и предоставляет учебные материалы, инструкции по использованию и исходный код для скачивания.
4
Веб-сервер поддерживает отображение и экспорт результатов анализа микросателлитов в формате GFF3 для последующего анализа.
Research Object
MISA-web — веб-приложение для предсказания микросателлитов по данным повторного секвенирования
Research Subject
Выявление и характеристика микросателлитов, включая улучшенное обнаружение составных микросателлитов и экспорт результатов в формате GFF3
Publication Details
Publication Date
2017-04-06
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest