Исследование полиморфизмов генов TNF-α, IFN-γ, IL-10, TGF-β и IL-6 в когорте специалистов, работавших в первую волну пандемии в Бразильской Амазонии

Генетические полиморфизмы в генах, обеспечивающих формирование эффективного иммунного ответа хозяина, такие как однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) в генах IL-6, IFN-α, IFN-γ, IL-10 и TGF-β, могут приводить к неблагоприятным клиническим исходам или повышенной восприимчивости к заболеваниям. Целью данной работы было оценить эпидемиологический и генетический профиль работников медицинских учреждений в период первой волны пандемии. Была проведена исследование «случай‑контроль» с выборкой удобства среди работников медицинских учреждений Белема, штат Пара, Северная Бразилия (N = 213), разделённых на группы по симптоматике (асимптомные, AS, n = 91; симптомные, SI, n = 122) и по тяжести, классифицированной по данным компьютерной томографии грудной клетки (симптомные с поражением легких, SCP, n = 37; симптомные без поражения легких, SSP, n = 8). Генотипирование выполняли методом секвенирования Сэнгера для SNP: TNF-α -308 G/A (rs1800629), IFN-γ +874 T/A (rs2430561), TGF-β кодон 10 (rs1982073) и кодон 25 (rs1800471), IL-6 -174 G/C (rs180079), IL-10 -1082 A/T (rs1800896), -819 C/T (rs1800871) и -592 A/C (rs1800872). Статистический анализ проведён с использованием программы Epilfo. Наблюдалась значимая связь между наличием сопутствующих заболеваний и плохим прогнозом COVID-19 (в особенности связь с избыточной массой тела и ожирением). Только SNP TNF-α -308 G/A был значимо ассоциирован с симптомами и тяжестью COVID-19; это наблюдение сохраняло значимость после корректировки множественных сравнений при уровне ложного обнаружения (FDR) < 0.05. Эти данные могут помочь врачам и научному сообществу понять влияние генетических и эпидемиологических факторов в борьбе с COVID-19.