Масс-спектрометрия MALDI-TOF: перспективная технология для идентификации микроорганизмов и диагностики

В настоящее время микроорганизмы наиболее надежно идентифицируют с помощью секвенирования генов 16S рРНК и 18S рРНК. Однако в последние годы масс-спектрометрия с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией и времяпролетным анализом (MALDI-TOF MS) стала перспективным инструментом для идентификации микроорганизмов и диагностики. При проведении MALDI-TOF MS микроорганизмы идентифицируют либо по интактным клеткам, либо по клеточным экстрактам. Этот метод является быстрым и чувствительным, а также экономичным с точки зрения трудозатрат и стоимости. Микробиологи быстро внедрили эту технологию и сообщили о ее применении для различных целей, включая идентификацию микроорганизмов и типирование штаммов, эпидемиологические исследования, выявление агентов биологического оружия, обнаружение возбудителей заболеваний, передаваемых через воду и пищу, выявление антибиотикорезистентности, а также обнаружение патогенов крови и мочевых путей. Ограничение технологии заключается в том, что идентификация новых изолятов возможна только в том случае, если спектральная база данных содержит пептидные масс-отпечатки типовых штаммов соответствующих родов, видов, подвидов или штаммов. В этом обзоре представлен обзор современного состояния и последних применений масс-спектрометрии для идентификации микроорганизмов. Также рассматривается полезность этой перспективной технологии для диагностики заболеваний, вызываемых бактериями, вирусами и грибами.