Консервативные последовательности в интроне Drosophila mod(mdg4) способствуют поли(А)-независимой терминации транскрипции и транс-сплайсингу

Альтернативный сплайсинг (АС) представляет собой регуляторный механизм экспрессии генов, значительно расширяющий кодирующий потенциал геномов за счет возможности образования нескольких мРНК из одного гена. У Drosophila локус mod(mdg4) является экстремальным примером АС: посредством транс-сплайсинга он продуцирует более 30 различных мРНК, объединяя общие экзоны и вариабельные 3'-экзоны, образующиеся при использовании альтернативных промоторов. Для картирования участков, необходимых для транс-сплайсинга, мы разработали метод количественной оценки событий транс-сплайсинга и идентифицировали участок длиной 73 п. н. в последнем общем интроне, критически важный для транс-сплайсинга трех пре-мРНК, синтезируемых с разных цепей ДНК. Мы также обнаружили, что консервативные последовательности в дистальной части последнего общего интрона индуцируют полиаденилирование-независимую терминацию транскрипции и обогащены задержавшейся РНК-полимеразой II (RNAP II). Эти результаты позволяют предположить, что все мРНК mod(mdg4) образуются путем транс-соединения 5'-сайта сплайсинга в последнем общем экзоне с 3'-сайтом сплайсинга в одном из альтернативных экзонов.