Молекулярные представления в разработке лекарственных средств с использованием искусственного интеллекта: обзор и практическое руководство

Технологические достижения прошлого столетия, ознаменовавшиеся компьютерной революцией и появлением технологий высокопроизводительного скрининга в разработке лекарственных средств, открыли путь к компьютерному анализу и визуализации биоактивных молекул. Для этого возникла необходимость представлять молекулы в синтаксисе, читаемом компьютерами и понятном ученым из различных областей. За эти годы было разработано большое количество химических представлений; их многообразие обусловлено быстрым развитием компьютеров и сложностью создания представления, охватывающего все структурные и химические характеристики. Здесь мы рассматриваем некоторые из наиболее распространенных электронных представлений молекул и макромолекул, используемых при разработке лекарственных средств, многие из которых основаны на графовых представлениях. Кроме того, мы описываем применение этих представлений в разработке лекарственных средств с использованием искусственного интеллекта. Наша цель — предоставить краткое руководство по структурным представлениям, необходимым для практического применения искусственного интеллекта в разработке лекарственных средств. Этот обзор предназначен для исследователей, имеющих небольшой опыт работы с химическими представлениями и планирующих заниматься приложениями на стыке этих областей.