Анализ генетической вариабельности белок-кодирующих участков у 60 706 человек
Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans
2016-08-01
SCID: 54.1/7gaa9p5a
Discuss with AI
Консорциум агрегации экзомовсеквенирование экзомаметрики патогенностибелок-кодирующая генетическая вариабельностьварианты, обрывающие трансляцию белка
Figures from the paper
Abstract (AI)
Крупномасштабные референсные наборы данных о генетической вариабельности человека имеют критическое значение для медицинской и функциональной интерпретации изменений последовательности ДНК. В настоящей работе описаны объединение и анализ высококачественных данных секвенирования экзома (белок-кодирующей области) для 60 706 лиц различного происхождения, полученных в рамках Консорциума по агрегации данных экзома (Exome Aggregation Consortium, ExAC). Этот каталог генетического разнообразия человека содержит в среднем один вариант на каждые восемь оснований экзома и предоставляет прямые доказательства широко распространённой повторной мутагенной изменчивости. С помощью этого каталога были рассчитаны объективные показатели патогенности вариантов последовательности и выявлены гены, подвергающиеся сильному отбору против различных классов мутаций; обнаружено 3 230 генов с почти полным дефицитом предполагаемых вариантов, обрывающих белок, причём у 72% этих генов в настоящее время не установлен фенотип заболевания человека. Наконец, показано, что эти данные можно использовать для эффективной фильтрации предполагаемых вариантов, вызывающих заболевания, и для выявления человеческих «нокаутирующих» вариантов в белок-кодирующих генах. Представлены данные секвенирования экзома 60 706 людей различного географического происхождения, что позволяет получить представление о генетической вариабельности между популяциями и прояснить взаимосвязь между вариантами ДНК и заболеваниями человека. В рамках проекта Exome Aggregation Consortium (ExAC) Дэниел Макартур и его коллеги сообщают о получении и анализе высококачественных данных секвенирования экзома 60 706 лиц различного происхождения. Эти данные представляют наиболее полный на сегодняшний день каталог генетической вариабельности белок-кодирующих участков человека и обеспечивают беспрецедентное разрешение при анализе крайне редких вариантов в нескольких человеческих популяциях. Каталог находится в свободном доступе и служит важной референсной панелью для клинической интерпретации генетических вариантов и выявления генов, связанных с заболеваниями.
Key Findings
1
Среди 3 230 генов с почти полным дефицитом предполагаемых обрывающих белок вариантов 72% не имеют установленного фенотипа заболевания у человека.
2
Данные ExAC позволяют рассчитывать объективные показатели патогенности вариантов и выявляют сильный отбор против нескольких классов мутаций в генах человека.
3
Ресурс ExAC объединяет высококачественные данные секвенирования экзома 60 706 людей различного происхождения, создавая comprehensive-каталог белок-кодирующих вариантов человека.
4
Каталог выявляет примерно один генетический вариант на каждые восемь оснований экзома и напрямую подтверждает широкую распространённость повторного возникновения мутаций.
5
Ресурс обеспечивает эффективную фильтрацию потенциально вызывающих заболевания вариантов и обнаружение человеческих нокаутирующих вариантов в белок-кодирующих генах.
Research Object
Агрегированные высококачественные данные экзомного (белок-кодирующего) секвенирования 60 706 человек (ExAC)
Research Subject
Распределение, повторное возникновение, патогенность, отбор и связь с заболеваниями генетических вариантов в белок-кодирующих областях генома человека среди различных популяций
Publication Details
Publication Date
2016-08-01
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest