Сборка генома и геопространственная филогеномика постельного клопа Cimex lectularius
Genome assembly and geospatial phylogenomics of the bed bug Cimex lectularius
2016-02-02
SCID: 54.1/7tz9s4uw
Discuss with AI
геном Cimex lectulariusРНК-секвенированиеэндосимбионт Wolbachiaсборка геномагеопространственная филогеномика
Figures from the paper
Abstract (AI)
Постельный клоп (Cimex lectularius) на протяжении тысячелетий остается постоянным вредителем человека, однако генетические основы его базовой биологии и адаптации к условиям высокой плотности населения в городах в значительной степени неизвестны. В данной работе представлены сборка, аннотация и филогенетическое картирование генома Cimex lectularius размером 697,9 Мб с показателем N50, равным 971 кб, выполненные с использованием технологий секвенирования длинных и коротких прочтений. Временной ряд RNA-seq для всех пяти стадий развития, а также взрослых самцов и самок позволил получить 36 985 моделей кодирующих и некодирующих генов. Наиболее выраженное изменение экспрессии генов в течение жизненного цикла происходит после питания человеческой кровью и включает гены эндосимбионта Wolbachia, демонстрирующего одновременную и координированную реакцию хозяина и комменсала на гематофагическую активность. Эти данные представляют собой ценный генетический ресурс для картирования распространенности и плотности C. lectularius среди людей и в городах, что может помочь отслеживать, регулировать и контролировать заражение постельными клопами.
Key Findings
1
Собран и аннотирован геном Cimex lectularius размером 697,9 Мб с использованием длинных и коротких чтений; показатель N50 составил 971 кб.
2
Питание кровью вызывало согласованные транскрипционные ответы как у клопа, так и у его эндосимбионта Wolbachia.
3
РНК-секвенирование пяти стадий развития и взрослых самцов и самок выявило 36 985 моделей кодирующих и некодирующих генов.
4
Геномные и экспрессионные ресурсы позволяют проводить филогенетические и географические исследования для отслеживания, контроля и борьбы с заражённостью клопами в разных популяциях людей и городах.
5
Наиболее выраженное изменение экспрессии в жизненном цикле происходило после питания человеческой кровью.
Research Object
обыкновенный постельный клоп (Cimex lectularius), включая его геном, стадии развития и эндосимбионт Wolbachia
Research Subject
генетическая основа биологии постельного клопа и его адаптации к среде с высокой плотностью людей, включая экспрессию генов на протяжении жизненного цикла и согласованные реакции хозяина и Wolbachia на питание человеческой кровью
Publication Details
Publication Date
2016-02-02
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest