Молекулярный анализ гена S-гликопротеина коронавирусов крупного рогатого скота, выделенных в Японии в 1999–2006 гг.

Всего было собрано 55 изолятов коронавируса крупного рогатого скота (BCoV) из случаев кишечных и респираторных заболеваний, зарегистрированных в Японии в 1999–2006 гг. Филогенетический анализ полиморфной области гена S-гликопротеина этих изолятов вместе с другими известными штаммами классифицировал штаммы и изоляты BCoV на четыре кластера. Современные полевые изоляты демонстрируют выраженное генетическое расхождение по отношению к прототипным энтерическим штаммам BCoV — Mebus, Quebec, Kakegawa, F15 и LY138 — и изменились по трем различным направлениям в течение 8 лет. Эти данные указывают на то, что генетическое расхождение в полиморфной области S-гликопротеина существенно продвинулось; следовательно, молекулярный анализ этой области должен быть полезен при изучении молекулярной эпидемиологии BCoV. Кроме того, на основании различий в аминокислотах между изолятами наше исследование не выявило наличие определенных генетических маркеров патогенности и клинических симптомов в этой полиморфной области.