ДНК-штрихкод для наземных растений

A DNA barcode for land plants
CBOL Plant Working Group1, Peter M. Hollingsworth, Laura L. Forrest, John L. Spouge, Mehrdad Hajibabaei, Sujeevan Ratnasingham, Michelle van der Bank, Mark W. Chase, Robyn S. Cowan, David L. Erickson, Aron J. Fazekas, Sean W. Graham, Karen E. James, Ki-Joong Kim, W. John Kress, Harald Schneider, Jonathan Van Alphen-Stahl, Spencer C. H. Barrett, Cássio van den Berg, Diego Bogarín, Kevin S. Burgess, Kenneth M. Cameron, Mark A. Carine, Juliana Chacón, Alexandra Clark, James J. Clarkson, Ferozah Conrad, Dion S. Devey, C. S. Ford, Terry A. Hedderson, Michelle L. Hollingsworth, Brian C. Husband, Laura J. Kelly, Prasad Kesanakurti, Jung Sung Kim, Young‐Dong Kim, Renaud Lahaye, Hae-Lim Lee, David G. Long, Santiago Madriñán, Olivier Maurin, Isabelle Meusnier, Steven G. Newmaster, Chong-Wook Park, Diana M. Percy, Gitte Petersen, James Richardson, Gerardo A. Salazar, Vincent Savolainen, Ole Seberg, M. J. Wilkinson, Dong‐Keun Yi, Damon P. Little
2009-08-04
SCID:  54.1/aay2b62q Discuss with AI
ДНК-баркодированиеназемные растенияпластидные участки ДНКбаркод rbcL+matKидентификация видов
Abstract (AI)
ДНК-штрихкодирование предполагает секвенирование стандартного участка ДНК для идентификации видов. Однако до сих пор не было достигнуто согласия относительно того, какие участки следует использовать для штрихкодирования наземных растений. Чтобы выработать рекомендацию научного сообщества относительно стандартного растительного штрихкода, мы сравнили эффективность 7 основных кандидатных участков пластидной ДНК (спейсер atpF-atpH, ген matK, ген rbcL, ген rpoB, ген rpoC1, спейсер psbK-psbI и спейсер trnH-psbA). На основании оценки возможности амплификации и секвенирования, качества последовательностей и степени видовой дискриминации мы рекомендуем двухлокусную комбинацию rbcL+matK в качестве растительного штрихкода. Этот базовый двухлокусный штрихкод обеспечит универсальную основу для регулярного использования данных о последовательностях ДНК при идентификации образцов и будет способствовать обнаружению ранее не распознанных видов наземных растений.
Key Findings
1
Кандидатные участки оценивались по извлекаемости, качеству последовательностей и способности различать виды.
2
Авторы рекомендуют комбинацию двух локусов rbcL и matK в качестве стандартного базового штрихкода для наземных растений.
3
Предлагаемый штрихкод создаёт универсальную основу для рутинной идентификации образцов и может способствовать обнаружению ранее нераспознанных видов растений.
4
В исследовании сравниваются семь ведущих участков пластидной ДНК для стандартизации штрихкодирования видов наземных растений.
Research Object

наземные растения и их кандидатные участки пластидной ДНК для штрихкодирования

Research Subject

пригодность к получению, качество последовательностей и эффективность видовой дискриминации кандидатных участков пластидной ДНК для идентификации растений

Publication Details
Publication Date
2009-08-04
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
CBOL Plant Working Group1
Peter M. Hollingsworth
Laura L. Forrest
John L. Spouge
Mehrdad Hajibabaei
Sujeevan Ratnasingham
Michelle van der Bank
Mark W. Chase
Robyn S. Cowan
David L. Erickson
Aron J. Fazekas
Sean W. Graham
Karen E. James
Ki-Joong Kim
W. John Kress
Harald Schneider
Jonathan Van Alphen-Stahl
Spencer C. H. Barrett
Cássio van den Berg
Diego Bogarín
Kevin S. Burgess
Kenneth M. Cameron
Mark A. Carine
Juliana Chacón
Alexandra Clark
James J. Clarkson
Ferozah Conrad
Dion S. Devey
C. S. Ford
Terry A. Hedderson
Michelle L. Hollingsworth
Brian C. Husband
Laura J. Kelly
Prasad Kesanakurti
Jung Sung Kim
Young‐Dong Kim
Renaud Lahaye
Hae-Lim Lee
David G. Long
Santiago Madriñán
Olivier Maurin
Isabelle Meusnier
Steven G. Newmaster
Chong-Wook Park
Diana M. Percy
Gitte Petersen
James Richardson
Gerardo A. Salazar
Vincent Savolainen
Ole Seberg
M. J. Wilkinson
Dong‐Keun Yi
Damon P. Little
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat →
Make a presentation
100%