Валидация структур в химической кристаллографии
Structure validation in chemical crystallography
2009-01-19
SCID: 54.1/bhf8agyk
Discuss with AI
CIF (файл кристаллографической информации)checkCIF/PLATONхимическая кристаллографияпроверка структурыALERTS валидации
Figures from the paper
Abstract (AI)
Автоматизированная валидация структур была внедрена в химической кристаллографии около 12 лет назад как инструмент для помощи практикам в условиях экспоненциального роста числа анализов кристаллических структур. С тех пор валидация развилась в удобный веб-сервис checkCIF/PLATON Международного союза кристаллографии (IUCr). Результат определения кристаллической структуры должен предоставляться в виде читаемого компьютером файла в формате CIF. Программное обеспечение для проверки тестирует данные в CIF на полноту, качество и согласованность. Кроме того, проверяемая структура анализируется на предмет неполного анализа, ошибок в анализе и соответствующих вопросов, требующих проверки. Генерируется отчет о валидации в виде списка ALERT (предупреждений) по вопросам, которые необходимо исправить, проверить или прокомментировать. Валидация структур во многом устранила очевидные проблемы в отчетах о структурах, публикуемых в журналах IUCr, такие как рафинирование в пространственной группе с чрезмерно низкой симметрией. В статье сообщается о текущем состоянии валидации структур и возможных будущих расширениях.
Key Findings
1
Автоматизированная проверка структур была введена примерно 12 лет назад для помощи при быстром росте анализов кристаллических структур.
2
Валидация структур во многом устранила очевидные проблемы в публикациях IUCr, например, осреднение в группах симметрии слишком низкой симметрии.
3
Программное обеспечение проверяет данные CIF на полноту, качество, согласованность, незавершённый анализ, ошибки анализа и вопросы, требующие проверки.
4
В статье представлен обзор текущего состояния валидации структур и обсуждаются возможные будущие расширения.
5
Валидация эволюционировала в веб-сервис checkCIF/PLATON IUCr, требующий представления результатов в формате CIF.
6
Валидация формирует отчёты в виде списков ALERTS, указывающих проблемы, требующие исправления, проверки или комментария.
Research Object
Автоматизированная служба валидации структур в химической кристаллографии (сервис checkCIF/PLATON IUCr для проверки результатов в формате CIF)
Research Subject
Проверка и оценка отчётных данных кристаллической структуры на полноту, качество, согласованность, ошибки анализа и релевантные проблемы (формирование отчёта ALERT и выявление ошибок, например неверной симметрии группЫ пространств), а также текущее состояние и возможные расширения этого процесса валидации
Publication Details
Publication Date
2009-01-19
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest