Эволюционная история и глобальное распространение линии Beijing Mycobacterium tuberculosis

Matthias Merker; Camille Blin; Stefano Mona; Nicolas Duforet-Frebourg; Sophie Lecher; Eve Willery; Michaël G. B. Blum; Sabine Rüsch–Gerdes; Igor Mokrousov; Eman Aleksic; Caroline Allix‐Béguec; Annick Antierens; Ewa Augustynowicz‐Kopeć; Marie Ballif; Francesca Barletta; Hans‐Peter Beck; Clifton E. Barry; Maryline Bonnet; Emanuele Borroni; Isolina Campos-Herrero; Daniela María Cirillo; Helen Cox; Suzanne M. Crowe; Valeriu Crudu; Roland Diel; Francis Drobniewski; Maryse Fauville‐Dufaux; Sébastien Gagneux; Solomon Ghebremichael; M. Hanekom; Sven Hoffner; Wei-wei Jiao; Stobdan Kalon; Thomas A. Kohl; Irina Kontsevaya; Troels Lillebæk; Shinji Maeda; Vladyslav Nikolayevskyy; Michael Rasmussen; Nalin Rastogi; Sofía Samper; Elisabeth Sánchez-Padilla; Branislava Savić; Isdore Chola Shamputa; Adong Shen; Li‐Hwei Sng; Petras Stakėnas; Kadri Toit; Francis Varaine; Dragana Vuković; Céline Wahl; Robin M. Warren; Philip Supply; Stefan Niemann; Thierry Wirth

doi:10.1038/ng.3195

Эволюционная история и глобальное распространение линии Beijing Mycobacterium tuberculosis

Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage

Matthias Merker, Camille Blin, Stefano Mona, Nicolas Duforet-Frebourg, Sophie Lecher, Eve Willery, Michaël G. B. Blum, Sabine Rüsch–Gerdes, Igor Mokrousov, Eman Aleksic, Caroline Allix‐Béguec, Annick Antierens, Ewa Augustynowicz‐Kopeć, Marie Ballif, Francesca Barletta, Hans‐Peter Beck, Clifton E. Barry, Maryline Bonnet, Emanuele Borroni, Isolina Campos-Herrero, Daniela María Cirillo, Helen Cox, Suzanne M. Crowe, Valeriu Crudu, Roland Diel, Francis Drobniewski, Maryse Fauville‐Dufaux, Sébastien Gagneux, Solomon Ghebremichael, M. Hanekom, Sven Hoffner, Wei-wei Jiao, Stobdan Kalon, Thomas A. Kohl, Irina Kontsevaya, Troels Lillebæk, Shinji Maeda, Vladyslav Nikolayevskyy, Michael Rasmussen, Nalin Rastogi, Sofía Samper, Elisabeth Sánchez-Padilla, Branislava Savić, Isdore Chola Shamputa, Adong Shen, Li‐Hwei Sng, Petras Stakėnas, Kadri Toit, Francis Varaine, Dragana Vuković, Céline Wahl, Robin M. Warren, Philip Supply, Stefan Niemann, Thierry Wirth

2015-01-19

SCID: 54.1/bwyyst68 Discuss with AI

линия Beijing Mycobacterium tuberculosisмультирезистентный туберкулёзфилогеографическая реконструкциямутации под положительным отборомполногеномное секвенирование

Abstract (AI)

Тьерри Вирт, Филипп Саппли, Штефан Ниманн и их коллеги проанализировали 4 987 штаммов Mycobacterium tuberculosis линии Beijing, выделенных в 99 странах. Они провели полногеномное секвенирование 110 репрезентативных штаммов, охарактеризовали глобальную структуру популяции и реконструировали эволюционную историю этой линии. Штаммы Mycobacterium tuberculosis линии Beijing распространены по всему миру и связаны с масштабным распространением туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью (MDR) в Евразии. В данной работе биогеографическая структура и эволюционная история этой линии были реконструированы на основе генетического анализа 4 987 изолятов из 99 стран и полногеномного секвенирования 110 репрезентативных изолятов. Показано, что эта линия первоначально возникла на Дальнем Востоке, откуда в ходе нескольких волн распространилась по всему миру. За последние 200 лет выявлены последовательные увеличения численности популяции этого патогена, практически совпавшие с промышленной революцией, Первой мировой войной и эпидемиями ВИЧ. Два MDR-клона этой линии начали распространяться по Центральной Азии и России одновременно с распадом системы общественного здравоохранения в бывшем Советском Союзе. Мутации, выявленные в генах, предположительно находящихся под действием положительного отбора и связанных с вирулентностью, могли способствовать расширению наиболее успешных ветвей этой линии.

Key Findings

За последние 200 лет численность этой популяции последовательно увеличивалась, что примерно совпадало с индустриализацией, Первой мировой войной и эпидемиями ВИЧ.

Мутации в генах, предположительно подвергавшихся положительному отбору и связанных с вирулентностью, могли способствовать расширению наиболее успешных ветвей линии.

Линию Beijing изучили на основе 4 987 изолятов из 99 стран и полногеномных последовательностей 110 репрезентативных штаммов.

Линия возникла на Дальнем Востоке, откуда затем распространилась по всему миру несколькими волнами.

Два мультирезистентных клона линии Beijing начали распространяться по Центральной Азии и России одновременно с распадом системы общественного здравоохранения бывшего Советского Союза.

Research Object

Штаммы линии Beijing Mycobacterium tuberculosis и их глобальные популяции

Research Subject

Биогеографическая структура, эволюционная история, глобальное распространение, рост численности популяции и возникновение МЛУ-клонов линии Beijing

Publication Details

DOI

10.1038/ng.3195

Publication Date

2015-01-19

Journal

Publisher

ISSN

Open access PDF

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/11044984

Access Type

Author Information

Authors

Matthias Merker

Camille Blin

Stefano Mona

Nicolas Duforet-Frebourg

Sophie Lecher

Eve Willery

Michaël G. B. Blum

Sabine Rüsch–Gerdes

Igor Mokrousov

Eman Aleksic

Caroline Allix‐Béguec

Annick Antierens

Ewa Augustynowicz‐Kopeć

Marie Ballif

Francesca Barletta

Hans‐Peter Beck

Clifton E. Barry

Maryline Bonnet

Emanuele Borroni

Isolina Campos-Herrero

Daniela María Cirillo

Helen Cox

Suzanne M. Crowe

Valeriu Crudu

Roland Diel

Francis Drobniewski

Maryse Fauville‐Dufaux

Sébastien Gagneux

Solomon Ghebremichael

M. Hanekom

Sven Hoffner

Wei-wei Jiao

Stobdan Kalon

Thomas A. Kohl

Irina Kontsevaya

Troels Lillebæk

Shinji Maeda

Vladyslav Nikolayevskyy

Michael Rasmussen

Nalin Rastogi

Sofía Samper

Elisabeth Sánchez-Padilla

Branislava Savić

Isdore Chola Shamputa

Adong Shen

Li‐Hwei Sng

Petras Stakėnas

Kadri Toit

Francis Varaine

Dragana Vuković

Céline Wahl

Robin M. Warren

Philip Supply

Stefan Niemann

Thierry Wirth

Download PDF

Make a presentation