Пилотное исследование расширенного неонатального скрининга 573 генов, связанных с тяжелыми наследственными заболеваниями, в Китае: результаты обследования 1127 новорожденных
A pilot study of expanded newborn screening for 573 genes related to severe inherited disorders in China: results from 1,127 newborns
2020-09-01
SCID: 54.1/dq7un6se
Discuss with AI
биохимический скринингчастоты носительстварасширенный неонатальный скринингнаследственные метаболические заболеваниясеквенирование нового поколения
Figures from the paper
Abstract (AI)
Обоснование: Неонатальный скрининг (NBS) в Китае в основном направлен на определение биохимических уровней метаболитов в крови, что может приводить к ложноотрицательным и ложноположительным результатам. Современный биохимический NBS включает скрининг метаболитов методом тандемной масс-спектрометрии (MS/MS), а также определение фенилаланина (Phe), тиреотропного гормона (TSH), 17-α-гидроксипрогестерона (17-OHP) и глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы (G6PD). Целью настоящего исследования было выяснить, может ли секвенирование нового поколения (NGS) образцов сухих пятен крови в сочетании с биохимическим скринингом повысить эффективность существующего скрининга, а также изучить частоты носительства мутаций в генах, обусловливающих нарушения метаболизма аминокислот, органических кислот и окисления жирных кислот, в данной когорте. Методы: Была разработана панель из 573 генов, связанных с тяжелыми наследственными заболеваниями, и проведено NGS у 1127 человек, прошедших биохимический неонатальный скрининг. Результаты NGS-скрининга новорожденных сравнивали с результатами биохимического исследования. Результаты: По данным NGS-скрининга, все четверо новорожденных с аномальными значениями G6PD являлись носителями гемизиготных мутаций G6PD, что соответствовало снижению ферментативной активности G6PD. Результаты NGS выявили пациента с компаундными гетерозиготными мутациями в гене SLC22A5, у которого в 2016 году биохимический результат был отрицательным. В 2019 году скрининг методом MS/MS выявил дефицит свободного карнитина, что соответствовало генетическим данным. Пятью генами с наиболее высокой частотой носительства мутаций среди обследованных новорожденных были PAH (1:56, 1,79%), ETFDH (1:81, 1,23%), MMACHC (1:87, 1,15%), SLC25A13 (1:102, 0,98%) и GCDH (1:125, 0,80%). Выводы: Наше исследование показало, что сочетание NGS с биохимическим скринингом может повысить эффективность современного неонатального скрининга. Это первое исследование частот носительства мутаций в 77 генах, вызывающих наследственные метаболические заболевания (IMD), в Китае.
Key Findings
1
Панель NGS из 573 генов была применена к образцам сухих пятен крови 1 127 китайских новорождённых одновременно с традиционным биохимическим скринингом.
2
У всех четырёх новорождённых с аномальными показателями G6PD выявлены гемизиготные мутации G6PD, подтвердившие результаты биохимического тестирования.
3
NGS выявило компаундные гетерозиготные мутации SLC22A5 у новорождённого с первоначально отрицательным биохимическим скринингом; позднее MS/MS обнаружил дефицит свободного карнитина.
4
Результаты показывают, что сочетание NGS с биохимическим скринингом может повысить эффективность неонатального скрининга и предоставляет данные о частотах носительства мутаций в 77 генах, связанных с наследственными метаболическими заболеваниями, в Китае.
5
Наиболее высокие частоты носительства мутаций отмечены для PAH (1:56), ETFDH (1:81), MMACHC (1:87), SLC25A13 (1:102) и GCDH (1:125).
Research Object
1 127 китайских новорождённых, проходящих расширенный неонатальный скрининг тяжёлых наследственных заболеваний с использованием NGS-панели из 573 генов в сочетании с биохимическим скринингом
Research Subject
Эффективность скрининга, соответствие биохимическим результатам и частоты носительства патогенных мутаций, связанных с наследственными метаболическими заболеваниями
Publication Details
Publication Date
2020-09-01
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest