Пилотное исследование расширенного неонатального скрининга 573 генов, связанных с тяжелыми наследственными заболеваниями, в Китае: результаты обследования 1127 новорожденных

A pilot study of expanded newborn screening for 573 genes related to severe inherited disorders in China: results from 1,127 newborns
Xuefan Gu, Yu Sun, Jun Guo, Yongguo Yu, Xiaomei Luo, Feng Xu, Lin Li, Zhiwei Lin, Jun Ye
2020-09-01

биохимический скринингчастоты носительстварасширенный неонатальный скринингнаследственные метаболические заболеваниясеквенирование нового поколения
Обоснование: Неонатальный скрининг (NBS) в Китае в основном направлен на определение биохимических уровней метаболитов в крови, что может приводить к ложноотрицательным и ложноположительным результатам. Современный биохимический NBS включает скрининг метаболитов методом тандемной масс-спектрометрии (MS/MS), а также определение фенилаланина (Phe), тиреотропного гормона (TSH), 17-α-гидроксипрогестерона (17-OHP) и глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы (G6PD). Целью настоящего исследования было выяснить, может ли секвенирование нового поколения (NGS) образцов сухих пятен крови в сочетании с биохимическим скринингом повысить эффективность существующего скрининга, а также изучить частоты носительства мутаций в генах, обусловливающих нарушения метаболизма аминокислот, органических кислот и окисления жирных кислот, в данной когорте. Методы: Была разработана панель из 573 генов, связанных с тяжелыми наследственными заболеваниями, и проведено NGS у 1127 человек, прошедших биохимический неонатальный скрининг. Результаты NGS-скрининга новорожденных сравнивали с результатами биохимического исследования. Результаты: По данным NGS-скрининга, все четверо новорожденных с аномальными значениями G6PD являлись носителями гемизиготных мутаций G6PD, что соответствовало снижению ферментативной активности G6PD. Результаты NGS выявили пациента с компаундными гетерозиготными мутациями в гене SLC22A5, у которого в 2016 году биохимический результат был отрицательным. В 2019 году скрининг методом MS/MS выявил дефицит свободного карнитина, что соответствовало генетическим данным. Пятью генами с наиболее высокой частотой носительства мутаций среди обследованных новорожденных были PAH (1:56, 1,79%), ETFDH (1:81, 1,23%), MMACHC (1:87, 1,15%), SLC25A13 (1:102, 0,98%) и GCDH (1:125, 0,80%). Выводы: Наше исследование показало, что сочетание NGS с биохимическим скринингом может повысить эффективность современного неонатального скрининга. Это первое исследование частот носительства мутаций в 77 генах, вызывающих наследственные метаболические заболевания (IMD), в Китае.
1
Панель NGS из 573 генов была применена к образцам сухих пятен крови 1 127 китайских новорождённых одновременно с традиционным биохимическим скринингом.
2
У всех четырёх новорождённых с аномальными показателями G6PD выявлены гемизиготные мутации G6PD, подтвердившие результаты биохимического тестирования.
3
NGS выявило компаундные гетерозиготные мутации SLC22A5 у новорождённого с первоначально отрицательным биохимическим скринингом; позднее MS/MS обнаружил дефицит свободного карнитина.
4
Результаты показывают, что сочетание NGS с биохимическим скринингом может повысить эффективность неонатального скрининга и предоставляет данные о частотах носительства мутаций в 77 генах, связанных с наследственными метаболическими заболеваниями, в Китае.
5
Наиболее высокие частоты носительства мутаций отмечены для PAH (1:56), ETFDH (1:81), MMACHC (1:87), SLC25A13 (1:102) и GCDH (1:125).

1 127 китайских новорождённых, проходящих расширенный неонатальный скрининг тяжёлых наследственных заболеваний с использованием NGS-панели из 573 генов в сочетании с биохимическим скринингом

Эффективность скрининга, соответствие биохимическим результатам и частоты носительства патогенных мутаций, связанных с наследственными метаболическими заболеваниями

Publication Details
Publication Date
2020-09-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Xuefan Gu
Yu Sun
Jun Guo
Yongguo Yu
Xiaomei Luo
Feng Xu
Lin Li
Zhiwei Lin
Jun Ye
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%