Workflow4Metabolomics: совместная исследовательская инфраструктура для вычислительной метаболомики

Сложная и быстро развивающаяся область вычислительной метаболомики требует создания совместных инфраструктур, в которых большой объем новых алгоритмов предварительной обработки данных, статистического анализа и аннотирования можно было бы легко интегрировать независимо от языка программирования, оценивать на эталонных наборах данных и объединять в цепочки для построения специализированных рабочих процессов пользователей. Мы разработали Workflow4Metabolomics (W4M) — первую полностью открытую и совместную онлайн-платформу для вычислительной метаболомики. W4M представляет собой виртуальную исследовательскую среду, созданную на основе веб-технологии платформы Galaxy. Она обеспечивает удобную интеграцию, обмен и выполнение отдельных модулей и рабочих процессов. Кроме того, весь фреймворк W4M и вычислительные инструменты можно загрузить в виде виртуальной машины для локальной установки. Доступность и реализация: главная страница http://workflow4metabolomics.org позволяет пользователям создать личную учетную запись и получить доступ к инфраструктуре. Разработкой и поддержкой W4M занимаются Французский институт биоинформатики (IFB) и Французская инфраструктура метаболомики и флюксомики (MetaboHUB). Контакт: contact@workflow4metabolomics.org.