Данные о штаммах Bacillus anthracis, выделенных из вечной мерзлоты в тундровой зоне России

В статье описаны штаммы Bacillus anthracis, выделенные во время вспышки сибирской язвы на полуострове Ямал летом 2016 года и независимо выделенные в Якутии в 2015 году. Общей особенностью этих штаммов является их сохранение в вечной мерзлоте, откуда они были извлечены либо вследствие таяния вечной мерзлоты (ямальские штаммы), либо в результате палеонтологических раскопок (якутские штаммы). Все штаммы, выделенные на Ямале, имеют идентичный генотип и относятся к линии B.Br.001/002, что указывает на общий источник инфекции на территории протяжённостью более 250 км. В отличие от них, во время раскопок в Якутии из одной ямы были выделены три генетически различных штамма. Один штамм относится к B.Br.001/002; анализ полногеномных последовательностей показал, что он наиболее близок к ямальским штаммам, несмотря на удалённость Ямала от Якутии. Два других штамма относятся к двум различным ветвям A.Br.008/011 — одной из наиболее примечательных политомий, описанных к настоящему времени у вида B. anthracis. Географическое распределение штаммов, относящихся к A.Br.008/011, позволяет предположить, что эта политомия возникла в XIII веке одновременно с формированием единой Монгольской империи, простиравшейся от Китая до Восточной Европы. Мы предлагаем эволюционную модель недавней эволюции B. anthracis, согласно которой линия B распространилась по всей Евразии, а затем была вытеснена линией A, за исключением некоторых географически изолированных районов.