ADMET-AI: платформа машинного обучения для оценки крупномасштабных библиотек химических соединений по ADMET
ADMET-AI: a machine learning ADMET platform for evaluation of large-scale chemical libraries
2024-06-21
SCID: 54.1/f7cce4bf
Discuss with AI
прогнозирование ADMETTDC ADMET Leaderboardвысокопроизводительный ADMET скринингплатформа машинного обучения
Figures from the paper
Abstract (AI)
Актуальность: Появление крупных химических репозиториев и комбинаторных химических пространств в сочетании с высокопроизводительным докингом и генеративным ИИ значительно расширило химическое разнообразие малых молекул для разработки лекарств. Выбор соединений для экспериментальной валидации требует фильтрации этих молекул на основе благоприятных лекарственных свойств, таких как абсорбция, распределение, метаболизм, выведение и токсичность (ADMET). Результаты: Мы разработали ADMET-AI, платформу машинного обучения, обеспечивающую быстрые и точные предсказания ADMET как в виде веб-сайта, так и в виде пакета Python. ADMET-AI имеет наивысший средний рейтинг в таблице лидеров TDC ADMET и в настоящее время является самым быстрым веб-ориентированным предиктором ADMET, сокращая время на 45% по сравнению со следующим по скорости публичным ADMET-веб-сервером. ADMET-AI также можно запускать локально: предсказания для миллиона молекул занимают всего 3,1 ч. Доступность и реализация: Платформа ADMET-AI свободно доступна как веб-сервер по адресу admet.ai.greenstonebio.com и как открытый пакет Python для локального пакетного предсказания на github.com/swansonk14/admet_ai (также архивирован на Zenodo по doi.org/10.5281/zenodo.10372930). Все данные и модели архивированы на Zenodo по doi.org/10.5281/zenodo.10372418.
Key Findings
1
ADMET-AI получила наивысший средний ранг в таблице лидеров TDC ADMET (Therapeutics Data Commons).
2
ADMET-AI — платформа машинного обучения, обеспечивающая быстрые и точные предсказания ADMET доступная как веб-сайт и пакет Python.
3
ADMET-AI поддерживает локальные пакетные предсказания в масштабе: предсказание ADMET для одного миллиона молекул занимает примерно 3,1 часа.
4
Все данные, модели и код ADMET-AI общедоступны (веб-сервер, открытый пакет Python и архивы на Zenodo).
5
Веб-сервер ADMET-AI является самым быстрым публичным веб-предсказателем ADMET, сокращая время предсказания на 45% по сравнению со следующим по скорости публичным сервером.
Research Object
Платформа машинного обучения ADMET-AI для предсказания ADMET‑свойств больших химических библиотек
Research Subject
Быстрое и точное предсказание и оценка ADMET (Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion, Toxicity)‑свойств для больших химических репозиториев и комбинаторных библиотек, включая показатели производительности (скорость, рейтинг) и масштабируемость пакетных предсказаний
Publication Details
Publication Date
2024-06-21
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
322
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest