SNP rs657152 не связан с уровнем вирусной нагрузки при COVID-19 или вероятностью заболевания в популяции европеоидов Восточной Сибири

SNP rs657152 Is Not Associated with the Level of Viral Load in COVID-19 or the Probability of Disease in the Population of Caucasians in Eastern Siberia
Е. А. Орлова, О. Б. Огарков, П. А. Хромова, V. V. Sinkov, М. А. Хаснатинов, С. Н. Жданова, Л. В. Рычкова, Л. И. Колесникова
2021-08-01

COVID-19популяция европеоидовСНП rs657152ПЦР TaqManвирусная нагрузка
Перекрестно воспроизводимые ассоциации с rs657152 в локусе 9q34.2c и rs11385942 в локусе 3p21.31, выявленные у пациентов с тяжелой формой COVID-19 в европеоидной популяции, требуют изучения этого феномена в различных популяциях, в том числе в качестве независимого биологического маркера. Были разработаны праймеры и зонды TaqMan для ПЦР-дискриминации аллелей A и C однонуклеотидного полиморфизма (SNP) rs657152. Полиморфизм локуса rs657152 A/C был определен у 129 пациентов с COVID-19 и в контрольной группе из 466 здоровых лиц. Значимых различий в частотах аллелей A и C — соответственно 0,47/0,53 и 0,45/0,55 у пациентов и здоровых лиц — не выявлено. Также не обнаружено различий в распределении аллелей между пациентами с высокой вирусной нагрузкой в мазке (Ct в диапазоне 16–25) и пациентами со средней или низкой вирусной нагрузкой (Ct в диапазоне 26–40).
1
У жителей Восточной Сибири европеоидного происхождения частоты аллелей rs657152 были сходными у пациентов с COVID-19 и здоровых лиц: 0,47/0,53 против 0,45/0,55.
2
Значимой связи между генотипом или распределением аллелей rs657152 и вероятностью заболевания COVID-19 не обнаружено.
3
Разработаны праймеры и TaqMan-зонды для различения аллелей A и C SNP rs657152.
4
Распределение аллелей rs657152 не различалось у пациентов с высокой вирусной нагрузкой (Ct 16–25) и со средней или низкой вирусной нагрузкой (Ct 26–40).

A/C-полиморфизм SNP rs657152 у больных COVID-19 и здоровых лиц кавказской популяции Восточной Сибири

Связи генотипного и аллельного распределения rs657152 с наличием COVID-19 и уровнем вирусной нагрузки

Publication Details
Publication Date
2021-08-01
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
8
Access Type
Author Information
Authors
Е. А. Орлова
О. Б. Огарков
П. А. Хромова
V. V. Sinkov
М. А. Хаснатинов
С. Н. Жданова
Л. В. Рычкова
Л. И. Колесникова
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%