ДНК-штрихкоды для обеспечения биобезопасности: идентификация инвазивных видов

Биобезопасность включает защиту от любых рисков, возникающих вследствие биологического ущерба, включая экономический ущерб от распространения насекомых-вредителей. Молекулярно-диагностические инструменты обеспечивают ценную поддержку быстрой и точной идентификации чужеродных видов, морфологически неразличимых между собой. Однако в настоящее время этим инструментам не хватает стандартизации. Они плохо приспособлены для адаптации в различных секторах и странах, а также для реагирования на изменение приоритетов в отношении вредителей. Представленные здесь данные указывают на ДНК-штрихкоды как на весьма перспективный способ решения этой проблемы. ДНК образцов совок и плодовых мух, задержанных на границе Новой Зеландии за последнее десятилетие, была повторно проанализирована с использованием подхода на основе последовательностного штрихкода гена cox1, кодирующего субъединицу I цитохром-c-оксидазы. Идентификацию видов сравнивали с историческим набором данных, полученным методом полимеразной цепной реакции с анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПЦР–ПДРФ) ядерной рДНК. Для этих групп видов согласие между методами составило соответственно 90 и 96%. Среди улучшений — отнесение ранее неопределённых образцов совок к семейству, роду или виду, а также более точное разрешение внутри комплексов видов плодовых мух. Анализ выявляет ряд преимуществ ДНК-штрихкодов, особенно их адаптивность и прогностическую ценность. Этот подход представляет собой реалистичную платформу для создания гораздо более гибкой системы, которую потенциально можно внедрить на глобальном уровне для быстрой и точной идентификации инвазивных чужеродных видов.