Библиотека вирусного ORFeome для системного генетического анализа взаимодействий хозяин-патоген

Вирусологические исследования традиционно сосредоточены на отдельных вирусах или семействах вирусов. Достижения в синтезе ДНК теперь позволяют в крупном масштабе конструировать отдельные генетические продукты, что обеспечивает систематическое изучение вирома. Здесь мы разработали баркодированную библиотеку примерно из 12 000 вирусных открытых рамок считывания (vORF) из 513 видов вирусов и использовали её для идентификации сотен вирусных регуляторов клеточной пролиферации, презентации антигенов по компатибельности с главным комплексом гистосовместимости класса I (MHC класса I) и сигнального пути интерферонов. Интеграция результатов этих скринов выявила уникальные фенотипические профили и функциональные модули vORF, что позволило детально охарактеризовать две ранее не охарактеризованные вирусные белка, MC162R и 151R вируса, вызывающего заболевание, подобное болезни Яба (YLDV), которые соответственно нарушают презентацию антигенов MHC класса I и сигнальную передачу интерферона (IFN)-β. В совокупности вирусный ORFeome предоставляет масштабируемую платформу для выяснения функций вирусных белков в масштабах всего вирома.