Замена осевого лиганда метионина у меди T1 на фенилаланиновый лиганд, характерный для грибковых лакказ (M298F), вызывает локальные структурные возмущения, приводящие к термической нестабильности и снижению каталитической эффективности малой лакказы Streptomyces coelicolor A3(2)

Substitution of the Methionine Axial Ligand of the T1 Copper for the Fungal-like Phenylalanine Ligand (M298F) Causes Local Structural Perturbations that Lead to Thermal Instability and Reduced Catalytic Efficiency of the Small Laccase from Streptomyces coelicolor A3(2)
Kairit Zovo, Hegne Pupart, Arie Van Wieren, Richard E. Gillilan, Qingqiu Huang, Sudipta Majumdar, Tiit Lukk
2022-02-09

мутация M298Fаксиальный лиганд меди T1рентгеновская кристаллографиямалая лакказатермическая стабильность
Многие промышленные процессы протекают при повышенных температурах или в широком диапазоне значений pH и солёности. Однако использование ферментов для проведения биокатализа в таких условиях часто непрактично или даже невозможно. Лакказы (EC 1.10.3.2), составляющие обширное семейство мультикупровых оксидаз, уже давно применяются в промышленности. Хотя грибные лакказы во многих отношениях считаются превосходящими бактериальные аналоги, в последнее время бактериальные лакказы привлекают всё больше внимания. Несмотря на более низкий окислительно-восстановительный потенциал по сравнению с грибными лакказами, бактериальные лакказы обычно обладают более высокой термической стабильностью, функционируют в более широком диапазоне pH, не содержат посттрансляционных модификаций и поэтому могут служить перспективным каркасом для направленной эволюции с целью получения ферментов с улучшенными свойствами. Ранее было опубликовано несколько исследований, посвящённых мутациям осевого лиганда в сайте меди T1. Однако структурные данные о локальных и глобальных изменениях, вызываемых этими мутациями, до сих пор основывались исключительно на результатах вычислительного анализа. В настоящем исследовании мы провели структурную и кинетическую характеристику нескольких наиболее часто описываемых мутаций осевого лиганда бактериальной малой лакказы (SLAC) из Streptomyces coelicolor. Если одна из мутаций (Met на Leu) повышает термическую стабильность фермента, то другая (Met на Phe) оказывает противоположный эффект. Рентгеновская кристаллография показала, что эти мутации вызывают локальную структурную перестройку сайта T1. Наш анализ подтверждает ранее полученные данные о том, что у SLAC точечные мутации, изменяющие идентичность осевого лиганда меди T1, недостаточны для существенного повышения каталитической эффективности и в некоторых случаях, напротив, могут неблагоприятно влиять на параметры термической стабильности фермента.
1
Мутации аксиального лиганда могут ухудшать параметры термостабильности, поэтому сами по себе недостаточны для улучшения свойств SLAC.
2
Одна лишь замена аксиального лиганда меди T1 не обеспечила существенного повышения каталитической эффективности бактериальной малой лакказы.
3
Мутация Met→Leu повысила термостабильность фермента, тогда как мутация Met→Phe вызвала термическую нестабильность.
4
Замена Met→Phe привела к локальным структурным возмущениям, связанным со снижением каталитической эффективности.
5
Рентгеноструктурный анализ показал, что замена аксиального метионинового лиганда меди T1 вызывает локальные структурные перестройки в малой лакказе Streptomyces coelicolor.

Мутантная малая лакказа M298F из Streptomyces coelicolor A3(2), в которой аксиальный метиониновый лиганд меди T1 заменён на фенилаланин

Локальные структурные перестройки в центре меди T1 и их влияние на термостабильность и каталитическую эффективность

Publication Details
Publication Date
2022-02-09
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
13
Access Type
Author Information
Authors
Kairit Zovo
Hegne Pupart
Arie Van Wieren
Richard E. Gillilan
Qingqiu Huang
Sudipta Majumdar
Tiit Lukk
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%