Метаболомика на основе масс-спектрометрии: руководство по аннотированию, количественному анализу и передовым практикам представления результатов
Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices
2021-07-01
SCID: 54.1/km4ac29v
Discuss with AI
лучшие практики отчетностиионное подавлениеметаболомика на основе масс-спектрометриианнотация метаболитовколичественное определение метаболитов
Figures from the paper
Abstract (AI)
Методы метаболомики на основе масс-спектрометрии позволяют одновременно обнаруживать и количественно определять многие тысячи метаболитных признаков. Однако идентификация соединений и надежное количественное определение значительно осложняются химической сложностью и динамическим диапазоном метаболома. Одновременное количественное определение множества метаболитов в сложных смесях дополнительно может осложняться подавлением ионов, фрагментацией и наличием изомеров. В настоящей работе представлены рекомендации, охватывающие пробоподготовку, проведение повторов и рандомизацию, количественное определение, восстановление и рекомбинацию, подавление ионов и ошибочную идентификацию пиков, для обеспечения высококачественного представления данных, полученных с помощью метаболомики на основе жидкостной и газовой хроматографии–масс-спектрометрии. Эта статья в формате «Перспектива», подготовленная большой группой экспертов по метаболомике, содержит рекомендации по передовым практикам и упрощенные руководящие принципы представления результатов для специалистов, использующих метаболомику на основе жидкостной и газовой хроматографии–масс-спектрометрии.
Key Findings
1
Точность измерения метаболитов в сложных смесях ограничивается ионной супрессией, фрагментацией и наличием изомерных соединений.
2
Масс-спектрометрическая метаболомика позволяет одновременно обнаруживать и количественно определять тысячи метаболитообразующих признаков, однако химическая сложность и широкий динамический диапазон затрудняют надежную идентификацию и количественную оценку.
3
В обзоре представлены экспертные рекомендации по подготовке образцов, репликации, рандомизации, количественному анализу, оценке извлечения и рекомбинации, а также контролю ионной супрессии и ошибочной идентификации пиков.
4
Рекомендации охватывают аннотацию соединений и количественное представление результатов для пользователей рабочих процессов на основе жидкостной и газовой хроматографии–масс-спектрометрии.
5
Предлагаемые лучшие практики и упрощенные рекомендации по отчетности направлены на повышение качества, прозрачности и надежности данных метаболомики, полученных методами жидкостной и газовой хроматографии в сочетании с масс-спектрометрией.
Research Object
данные и рабочие процессы метаболомики на основе жидкостной и газовой хроматографии–масс-спектрометрии
Research Subject
оптимальные практики аннотирования и количественного определения метаболитов, а также достоверной отчётности при анализе сложных смесей
Publication Details
Publication Date
2021-07-01
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
1137
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest