Метаболомика на основе масс-спектрометрии

В этом обзоре представлен обзор динамично развивающейся области метаболомики на основе масс-спектрометрии. Метаболомика направлена на всесторонний и количественный анализ широкого спектра метаболитов в биологических образцах. Эти многочисленные аналиты обладают очень разнообразными физико-химическими свойствами и встречаются на разных уровнях концентраций. Следовательно, всесторонние исследования в метаболомике в первую очередь представляют собой задачу аналитической химии, и в частности масс-спектрометрия обладает большим потенциалом как инструмент для такого рода исследований. Для метаболомики требуются специальные подходы к подготовке образцов, разделению и масс-спектрометрическому анализу. В обзоре описаны современные примеры таких подходов. Основное внимание уделено метаболическому «отпечатку» (metabolic fingerprinting) — технике, которая анализирует все обнаруживаемые аналиты в данном образце с последующей классификацией образцов и идентификацией дифференциально экспрессируемых метаболитов, определяющих классы образцов. Для выполнения этой сложной задачи требуются инструменты анализа данных, библиотеки метаболитов и базы данных. Поэтому также обсуждаются последние достижения в области биоинформатики метаболомики.