Синтетические данные в обобщаемой обучаемой нейровизуализации
Synthetic data in generalizable, learning-based neuroimaging
2024-01-01
SCID: 54.1/kv84y9qs
Discuss with AI
сегментация головного мозга (SynthSeg)рандомизация доменаобобщаемое машинное обучениеудаление черепа (SynthStrip)синтетические данные
Figures from the paper
Abstract (AI)
Синтетические данные зарекомендовали себя как привлекательный вариант для разработки методов машинного обучения в человеческой нейровизуализации, особенно в магнитно-резонансной томографии (МРТ) — модальности, контраст в которой в значительной степени зависит от оборудования и параметров сканирования. В этой ретроспективной статье дается обзор семейства недавно предложенных методов, основанных на синтетических данных, для обобщаемого машинного обучения в анализе мозговой МРТ. В основе этой методологии лежит концепция рандомизации доменов (domain randomization), предполагающая обучение нейронных сетей на чрезвычайно разнообразном наборе синтетически сгенерированных изображений с произвольными свойственными контрастами. Эта техника позволила получить устойчивые, адаптируемые модели, способные работать с различными контрастами МРТ, разрешениями и патологией, прямо «из коробки», без дообучения. Мы успешно применяли этот подход к задачам такой как сегментация всего мозга (SynthSeg), удаление черепа (skull-stripping, SynthStrip), регистрация (SynthMorph, EasyReg), сверхразрешение и перенос контраста МРТ (SynthSR). Помимо этих приложений, в статье обсуждаются и другие возможные случаи использования и направления будущих работ в нашей методологии. Нейронные сети, обученные на синтетических данных, обеспечивают возможность анализа клинических МРТ, включая большие ретроспективные наборы данных, значительно снижая (а иногда и полностью устраняя) необходимость в больших размеченных наборах данных, и представляют собой большие перспективы в качестве устойчивых инструментов для решения различных исследовательских задач.
Key Findings
1
Случайная генерализация доменов — обучение на сильно разнообразном наборе синтетически сгенерированных МР-изображений с случайными свойствами контраста — позволяет нейронным сетям обобщать на различные МР-контрасты, разрешения и патологии без дообучения.
2
Модели, обученные на синтетических данных, работают «из коробки» на клинических МР-изображениях, что облегчает анализ больших ретроспективных наборов данных и повышает устойчивость и адаптивность.
3
Модели, обученные на синтетических данных, успешно применены к задачам нейровизуализации: сегментация всего мозга (SynthSeg), удаление черепа (SynthStrip), регистрация (SynthMorph, EasyReg), суперрезолюция и перенос контраста МР (SynthSR).
4
Ретроспективный обзор выявляет методы на основе синтетических данных как перспективную рамку с дополнительными возможными случаями применения и направлениями будущих исследований в обобщаемом анализе МР-изображений мозга.
5
Использование синтетических данных значительно снижает или иногда полностью устраняет необходимость в больших размеченных наборах данных при анализе клинических и ретроспективных МР-данных.
Research Object
Модели машинного обучения на основе нейронных сетей для анализа МРТ головного мозга, обученные на синтетических нейроизображениях
Research Subject
Обобщаемость и устойчивость этих моделей к различным МРТ-контрастам, разрешениям, патологиям и задачам (сегментация, удаление черепа, регистрация, суперразрешение, перенос контраста), достигаемые за счёт обучения на синтетических данных с рандомизацией доменов
Publication Details
Publication Date
2024-01-01
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
27
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest
Источники этой статьи в scid.ai6
Обзор глубокого обучения: концепции, архитектуры сверточных нейронных сетей, проблемы, применения и перспективные направления2021
Мультимодальная МРТ выявляет стволовые связи, поддерживающие бодрствование в человеческом сознании2024
Обзор методов аугментации изображений для глубокого обучения2019
Бенчмарк мультимодальной сегментации изображений опухолей головного мозга (BRATS)2014
Магнитно-резонансное «отпечатковое» сканирование2013
Градиентное обучение для распознавания документов1998