Анализ метилирования ДНК: выбор подходящего метода

В быстро развивающейся области эпигенетики существует несколько методов определения статуса метилирования образцов ДНК. Однако выбор метода, наиболее подходящего для ответа на конкретный биологический вопрос, по-прежнему остается сложной задачей. Цель данного обзора — предложить биологам, особенно начинающим специалистам в области эпигенетики, простой алгоритм, который поможет выбрать наиболее подходящий анализ с учетом исследовательских задач. Прежде всего все методы разделены на две категории: методы, используемые для (1) выявления неизвестных эпигенетических изменений и (2) оценки метилирования ДНК в определенных регуляторных участках или представляющих интерес генах. Затем методы подробно рассматриваются и ранжируются по надежности, возможностям высокопроизводительного анализа и стоимости. Обзор охватывает большинство методов, доступных на сегодняшний день, с особым вниманием к коммерчески доступным наборам и другим простым и удобным решениям, доказавшим свою практическую полезность.