Филогенетический анализ штаммов коронавируса кошек во время эпизоотической вспышки инфекционного перитонита кошек

ОБОСНОВАНИЕ: Инфекция, вызванная коронавирусом кошек (FCoV), широко распространена. У небольшого процента кошек инфекция FCoV связана с летальным заболеванием — инфекционным перитонитом кошек (FIP). Генетически различающиеся вирулентные и авирулентные штаммы FCoV могут одновременно циркулировать в популяции кошек. ЦЕЛИ: Определить, являются ли штаммы FCoV у кошек с FIP близкородственными или генетически отличающимися от штаммов FCoV, выделенных из фекалий одновременно обследованных кошек без клинических признаков заболевания, во время эпизоотической вспышки FIP. ЖИВОТНЫЕ: Четыре кошки, подвергнутые эвтаназии по причине FIP, и 16 кошек без клинических признаков заболевания. МЕТОДЫ: Проспективное расследование вспышки было начато во время вспышки FIP среди кошек, находившихся в центре спасения и пристройства животных или пристроенных из него. У кошек с FIP отбирали посмертные образцы, а у кошек без клинических признаков заболевания — одновременно собранные образцы фекалий. Из образцов тканей и фекалий выделяли РНК; фрагменты генов FCoV подвергали обратной транскрипции, амплификации методом ПЦР с использованием новых праймеров и секвенированию. Последовательности выравнивали с помощью ClustalW и сравнивали с опубликованными последовательностями FCoV. РЕЗУЛЬТАТЫ: РНК FCoV обнаружена во всех 4 посмертных образцах от кошек с FIP и в 9 из 16 образцов фекалий от одновременно обследованных кошек без клинических признаков заболевания. Новые праймеры позволили успешно амплифицировать фрагменты 4 участков генома во всех FCoV-положительных образцах. Филогенетический анализ показал, что связанные с FIP штаммы FCoV из данной вспышки были очень близкородственны штаммам FCoV, выделенным из фекалий одновременно обследованных кошек без клинических признаков заболевания. ВЫВОДЫ И КЛИНИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ: Анализ последовательностей не выявил признаков присутствия генетически различающихся вирулентных и авирулентных штаммов FCoV во время этой вспышки FIP.