Филогения сильно дивергентных Echinosteliales (Amoebozoa)

Миксомицеты, или плазмодийные слизевики, широко распространены и являются обычными почвенными амёбами, способными образовывать макроскопические плодовые тела. Хотя их филогенетическое положение как монофилетической группы в составе Amoebozoa хорошо установлено, внутренние взаимоотношения остаются не полностью разрешёнными. У основания наиболее интенсивно изученной клады с тёмными спорами находится порядок Echinosteliales; его сильно дивергентные гены малой субъединицы рибосомной (18S) РНК представляют проблему для филогенетических реконструкций, поскольку характеризуются необычно длинными вариабельными спиралями с неопределённой вторичной структурой и высоким меж- и внутривидовым расхождением. Современная классификация признаёт два семейства: моногенерическое Echinosteliaceae и Clastodermataceae, включающее роды Barbeyella и Clastoderma. Для лучшего разрешения филогении Echinosteliales мы получили три новые последовательности гена 18S рРНК от Clastoderma и Echinostelium corynophorum. Филогенетические анализы указывают на полифилию семейства Clastodermataceae: Barbeyella ближе филогенетически к Echinostelium arboreum, чем к Clastoderma, тогда как Clastoderma debaryanum представляет собой наиболее раннюю ветвь внутри Echinosteliales. Мы также обнаружили, что E. corynophorum является ближайшим родственником загадочной Semimorula liquescens, бесстебельной модификации Echinosteliales. Обсуждаются возможные эволюционные пути у тёмноспоровых миксомицетов и предложено таксономическое обновление.