Комплексное полное экзомное и транскриптомное секвенирование спорадической аденомы околощитовидной железы

Integrated Whole-Exome and Transcriptome Sequencing of Sporadic Parathyroid Adenoma
Ya Hu, Xiang Zhang, Ou Wang, Ming Cui, Xiaobin Li, Mengyi Wang, Surong Hua, Quan Liao
2021-05-14

GCM2секвенирование РНКспорадическая аденома паращитовидной железынеконтролируемая консенсусная кластеризацияполнoэкзомное секвенирование
Цель: Гиперпаратиреоз является третьим по распространённости эндокринным заболеванием. На аденому околощитовидной железы (АОЖ) приходится примерно 85% случаев первичного гиперпаратиреоза, однако её молекулярный механизм изучен не полностью. Целью настоящего исследования было изучение генетических и транскриптомных профилей спорадической АОЖ. Методы: У 41 пациента с АОЖ было выполнено полное экзомное секвенирование (WES) и транскриптомное секвенирование (RNA-seq), а также проведено RNA-seq 5 образцов нормальной ткани околощитовидной железы. Были выявлены мутации генов и характерные изменения экспрессии. Для выяснения молекулярного механизма развития АОЖ проведена неконтролируемая консенсусная кластеризация данных RNA-seq. Проанализированы корреляции между данными секвенирования и клинико-патологическими характеристиками пациентов. Результаты: В 4 образцах была выявлена мутация, ранее не описанная при АОЖ. По данным RNA-seq, в образцах АОЖ по сравнению с нормальными образцами уровни экспрессии 84 генов были повышены, а 646 генов — снижены. Неконтролируемый кластерный анализ данных RNA-seq распределил пациентов на 10 подгрупп, связанных с мутациями или аномальной экспрессией ряда потенциально патогенных генов. Заключение: Были выявлены мутации при АОЖ. Согласно результатам кластерного анализа данных RNA-seq, cyclin D1, β-catenin, VDR, CASR и GCM2 могут быть важными факторами, определяющими профиль экспрессии генов при АОЖ.
1
В четырех опухолевых образцах выявлена мутация, ранее не описанная при аденоме околощитовидной железы.
2
По сравнению с нормальными тканями в аденомах околощитовидной железы экспрессия 84 генов была повышена, а 646 — снижена.
3
Cyclin D1, β-катенин, VDR, CASR и GCM2 могут играть важную роль в формировании профиля экспрессии генов аденом околощитовидной железы.
4
В 41 спорадической аденоме околощитовидной железы и пяти нормальных тканях выполнено комплексное полноэкзомное и транскриптомное секвенирование.
5
Неконтролируемая кластеризация транскриптомных данных разделила аденомы околощитовидной железы на 10 подгрупп, связанных с мутациями или аномальной экспрессией потенциально патогенных генов.

Спорадическая аденома околощитовидной железы и нормальная ткань околощитовидной железы

Генетические мутации, изменения транскриптомной экспрессии, молекулярные подгруппы и их связи с клинико-патологическими характеристиками при спорадической аденоме околощитовидной железы

Publication Details
Publication Date
2021-05-14
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
26
Access Type
Author Information
Authors
Ya Hu
Xiang Zhang
Ou Wang
Ming Cui
Xiaobin Li
Mengyi Wang
Surong Hua
Quan Liao
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%