Комплексное полное экзомное и транскриптомное секвенирование спорадической аденомы околощитовидной железы
Integrated Whole-Exome and Transcriptome Sequencing of Sporadic Parathyroid Adenoma
2021-05-14
SCID: 54.1/z8d2fsdg
Discuss with AI
GCM2секвенирование РНКспорадическая аденома паращитовидной железынеконтролируемая консенсусная кластеризацияполнoэкзомное секвенирование
Figures from the paper
Abstract (AI)
Цель: Гиперпаратиреоз является третьим по распространённости эндокринным заболеванием. На аденому околощитовидной железы (АОЖ) приходится примерно 85% случаев первичного гиперпаратиреоза, однако её молекулярный механизм изучен не полностью. Целью настоящего исследования было изучение генетических и транскриптомных профилей спорадической АОЖ. Методы: У 41 пациента с АОЖ было выполнено полное экзомное секвенирование (WES) и транскриптомное секвенирование (RNA-seq), а также проведено RNA-seq 5 образцов нормальной ткани околощитовидной железы. Были выявлены мутации генов и характерные изменения экспрессии. Для выяснения молекулярного механизма развития АОЖ проведена неконтролируемая консенсусная кластеризация данных RNA-seq. Проанализированы корреляции между данными секвенирования и клинико-патологическими характеристиками пациентов. Результаты: В 4 образцах была выявлена мутация, ранее не описанная при АОЖ. По данным RNA-seq, в образцах АОЖ по сравнению с нормальными образцами уровни экспрессии 84 генов были повышены, а 646 генов — снижены. Неконтролируемый кластерный анализ данных RNA-seq распределил пациентов на 10 подгрупп, связанных с мутациями или аномальной экспрессией ряда потенциально патогенных генов. Заключение: Были выявлены мутации при АОЖ. Согласно результатам кластерного анализа данных RNA-seq, cyclin D1, β-catenin, VDR, CASR и GCM2 могут быть важными факторами, определяющими профиль экспрессии генов при АОЖ.
Key Findings
1
В четырех опухолевых образцах выявлена мутация, ранее не описанная при аденоме околощитовидной железы.
2
По сравнению с нормальными тканями в аденомах околощитовидной железы экспрессия 84 генов была повышена, а 646 — снижена.
3
Cyclin D1, β-катенин, VDR, CASR и GCM2 могут играть важную роль в формировании профиля экспрессии генов аденом околощитовидной железы.
4
В 41 спорадической аденоме околощитовидной железы и пяти нормальных тканях выполнено комплексное полноэкзомное и транскриптомное секвенирование.
5
Неконтролируемая кластеризация транскриптомных данных разделила аденомы околощитовидной железы на 10 подгрупп, связанных с мутациями или аномальной экспрессией потенциально патогенных генов.
Research Object
Спорадическая аденома околощитовидной железы и нормальная ткань околощитовидной железы
Research Subject
Генетические мутации, изменения транскриптомной экспрессии, молекулярные подгруппы и их связи с клинико-патологическими характеристиками при спорадической аденоме околощитовидной железы
Publication Details
Publication Date
2021-05-14
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
26
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest