Полногеномный эволюционный анализ метилирования ДНК у эукариот

Метилирование цитозина у эукариот подавляет транскрипцию, но также происходит в пределах активных генов; при этом степень сохранности биологических механизмов метилирования остается неясной. Мы количественно оценили метилирование ДНК в 17 геномах эукариот и обнаружили, что метилирование тела генов сохраняется у растений и животных, тогда как избирательное метилирование транспозонов — нет. Мы показываем, что метилирование транспозонов растений в контексте CHG характерно также для зеленых водорослей, что исключение гистона H2A.Z из метилированной ДНК сохраняется у растений и животных, а также приводим свидетельства РНК-направляемого метилирования ДНК генов грибов. Наши данные показывают, что современные системы метилирования ДНК представляют собой сочетание консервативных и производных признаков, и свидетельствуют о том, что метилирование тела генов является древним свойством геномов эукариот.