Картирование взаимодействий энхансер–промотор (интерактом) по типам клеток мозга и связь с риском заболеваний

Некодирующая генетическая вариация является важным фактором фенотипического разнообразия, но её функциональная интерпретация затруднена. Для лучшего понимания общей генетической вариации, связанной с заболеваниями мозга, мы определили некодирующие регуляторные регионы для основных типов клеток человеческого мозга. В то время как психиатрические расстройства в первую очередь ассоциировались с вариантами в транскрипционных энхансерах и промоторах нейронов, варианты при спорадическом болезни Альцгеймера (AD) в основном локализовались в энхансерах микроглии. Карты интерактома, связывающие варианты риска заболеваний в клеточно‑типоспецифичных энхансерах с промоторами, выявили расширенную генетическую сеть микроглии при AD. Удаление энхансера, специфичного для микроглии и содержащего варианты риска AD, подавляло экспрессию BIN1 в микроглии, но не в нейронах или астроцитах. Эти результаты пересматривают и расширяют список генов, вероятно подвергающихся влиянию некодирующих вариантов при AD, и указывают на вероятные типы клеток, в которых они действуют.