Одностадийный мультиплексный ПЦР-анализ для характеристики комплексов Leishmania Нового Света

Single-Step Multiplex PCR Assay for Characterization of New World Leishmania Complexes
Eva Harris, Gerald Kropp, Alejandro Belli, Betzabé Mara Rodríguez, Nina Agabian
1998-07-01

комплексы Leishmania Нового Светамультиплексный ПЦР в один шагдифференциация L. braziliensis L. mexicana L. donovaniчувствительность 1 fg–10 pg ДНК (0.01–100 паразитов)сплайс-лидер РНК (mini-exon) повторов гена
Мы разработали ПЦР-анализ для одностадийной дифференциации трех комплексов Leishmania Нового Света (Leishmania braziliensis, Leishmania mexicana и Leishmania donovani). Этот мультиплексный анализ нацелен на повторы гена сплайсированного лидерного РНК-участка (мини-экзона) этих организмов и позволяет одновременно выявлять все три комплекса, формируя продукты разного размера для каждого комплекса. Анализ специфичен для рода Leishmania и не выявляет родственных кинетопластидных простейших, таких как Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei и Crithidia fasciculata. Он правильно идентифицировал виды Leishmania, широко распространенные в Центральной и Южной Америке. Чувствительность ПЦР-амплификации варьировала от 1 фг до 10 пг ДНК (от 0,01 до 100 паразитов) в зависимости от выявляемого комплекса. Неочищенные экстракты культивируемых паразитов, полученные простым кипячением разведенных культур, служили отличными матрицами для амплификации. Также были исследованы неочищенные препараты клинического материала. Анализ выявлял L. braziliensis в соскобах кожи из очагов кожного лейшманиоза, Leishmania chagasi в соскобах кожи при атипичном кожном лейшманиозе и L. mexicana в аспиратах очагов у инфицированных хомяков. Мы минимизировали требования к количеству материала и максимально упростили, ускорили анализ и повысили информативность его результатов, сделав метод пригодным для использования в лабораториях стран, эндемичных по лейшманиозу. Этот анализ должен быть полезен для быстрой идентификации паразитов Leishmania в странах эндемичных регионов, особенно там, где в одной географической области встречаются разные комплексы Leishmania.
1
Дизайн теста минимизирует потребности в материалах и максимизирует простоту и скорость, что делает его пригодным для лабораторий в эндемичных по лейшманиозу странах
2
Тест специфичен для рода Leishmania и не амплифицирует родственных кинетопластид (Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei, Crithidia fasciculata)
3
Анализ нацелен на повторы гена сплайс-лидерной РНК (мини-экзон) и дает продукты разного размера для каждого комплекса, что позволяет одновременное обнаружение
4
Грубые кипяченые экстракты культивируемых паразитов и сырые клинические материалы эффективно служат матрицей для ПЦР, обеспечивая простую подготовку образцов
5
Разработан одноступенчатый мультиплексный ПЦР, различающий три комплекса New World Leishmania (L. braziliensis, L. mexicana, L. donovani) в одной реакции
6
Чувствительность варьировала от 1 фг до 10 пг ДНК (эквивалент 0,01–100 паразитов), в зависимости от комплекса
7
Успешно идентифицированы виды Leishmania из широкого географического ареала Центральной и Южной Америки, включая обнаружение L. braziliensis, L. chagasi и L. mexicana в клинических/экспериментальных образцах

Одностадийный мультиплексный ПЦР-ассай для дифференциации комплексов New World Leishmania

Способность теста специфично обнаруживать и дифференцировать три комплекса New World Leishmania (L. braziliensis, L. mexicana, L. donovani) по повторам мини-экзона (spliced leader RNA), включая чувствительность (1 fg–10 pg ДНК), специфичность относительно родственных кинетопластид, работу на необработанных культуральных и клинических образцах и пригодность для быстрого идентифицирования in-country

Publication Details
Publication Date
1998-07-01
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Eva Harris
Gerald Kropp
Alejandro Belli
Betzabé Mara Rodríguez
Nina Agabian
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%