Инфекции Leishmania: молекулярные мишени и диагностика

Leishmania infections: Molecular targets and diagnosis
Mohammad Akhoundi, Tim Downing, Jan Votýpka, Katrin Kuhls, Julius Lukeš, Arnaud Cannet, Christophe Ravel, Pierre Marty, Pascal Delaunay, Mohamed Kasbari, Bruno Granouillac, Luigi Gradoni, Denis Séréno
2017-01-31

ДНК-методы обнаруженияклассификация видов Leishmaniaгеномная карта диагностических геновмолекулярные маркеры для диагностики
Прогресс в диагностике лейшманиозов зависит от разработки эффективных методов и выявления подходящих биомаркеров. Мы предлагаем обновлённую классификацию видов Leishmania и их синонимов. Представлена глобальная карта, подчёркивающая географию известных эндемичных видов Leishmania, патогенных для человека. Мы суммируем полный перечень методик, используемых в настоящее время, и обсуждаем их преимущества и ограничения. Доступные данные подчёркивают преимущества молекулярных маркеров с точки зрения чувствительности и специфичности для количественной оценки вариации от субродового уровня до видовых комплексов, (под)видов внутри комплексов и отдельных популяций и очагов инфекции. Каждому ДНК-ориентированному методу обнаружения сопоставлено подробное описание маркеров и праймеров и предложена классификация на основе роли каждой мишени и праймера в обнаружении, идентификации и количественной оценке инфекции лейшманиоза. Мы описываем геномную карту генов, информативных для диагностики, которые использовались для генотипирования Leishmania. Кроме того, мы предлагаем метод классификации, основанный на пригодности хорошо изученных молекулярных маркеров для типирования 21 известного вида Leishmania, патогенного для человека. Этот подход применим к недавно обнаруженным видам и к гибридным штаммам, возникшим в результате межвидовых скрещиваний. Разработка более эффективных и чувствительных диагностических методов и биомаркеров имеет решающее значение для улучшения программ контроля инфекций Leishmania.
1
Предложен метод классификации пригодности хорошо изученных молекулярных маркеров для типирования 21 известного вида Leishmania, патогенного для человека, применимый к новым видам и гибридам между видами.
2
Представлено всестороннее резюме текущих диагностических методов с обсуждением их преимуществ и ограничений.
3
Обрисована геномная карта генов, информативных для диагностики и использованных в генотипировании Leishmania.
4
Представлена глобальная карта, показывающая географическое распространение видов Leishmania, патогенных для человека.
5
Предложена обновлённая классификация видов Leishmania и их синонимов.
6
Для каждого ДНК‑метода детально описаны маркеры и праймеры и предложена классификация по их ролям в обнаружении, идентификации и количественной оценке.
7
Молекулярные (ДНК‑основные) маркеры отмечены как обладающие повышенной чувствительностью и специфичностью на таксономических уровнях от подрода до отдельных популяций.
8
Авторы подчёркивают, что разработка более эффективных и чувствительных методов диагностики и биомаркеров необходима для улучшения программ контроля инфекций Leishmania.

Виды Leishmania, патогенные для человека (включая их геномы, молекулярные маркеры и гибридные штаммы)

Молекулярные мишени и диагностические методы для обнаружения, идентификации, типирования и количественной оценки инфекций Leishmania, включая оценку/классификацию маркеров, праймеров и информативных геномных локусов

Publication Details
Publication Date
2017-01-31
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Mohammad Akhoundi
Tim Downing
Jan Votýpka
Katrin Kuhls
Julius Lukeš
Arnaud Cannet
Christophe Ravel
Pierre Marty
Pascal Delaunay
Mohamed Kasbari
Bruno Granouillac
Luigi Gradoni
Denis Séréno
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%