Генетические взаимоотношения клинических изолятов Streptococcus pneumoniae, Streptococcus oralis и Streptococcus mitis: характеристика «атипичных» пневмококков и организмов, связанных с S. mitis, содержащих гены, кодирующие факторы вирулентности S. pneumoniae

Группа оральных стрептококков (филогенетическая группа mitis) в настоящее время включает девять признанных видов, хотя эту группу традиционно сложно классифицировать, и в течение многих лет номенклатура часто менялась. Пневмококк (Streptococcus pneumoniae), важный человеческий патоген, традиционно отличается от наиболее близких родственных видов оральных стрептококков Streptococcus mitis и Streptococcus oralis по трем отличительным признакам: чувствительности к оптокоину, растворимости в желчи и агглютинации с анти-пневмококковыми антителами к полисахаридной капсуле. Однако в литературе имеется много сообщений о пневмококках, лишенных одного или нескольких из этих определяющих признаков. Иногда называемые «атипичными» пневмококками, эти изоляты могут вызывать значительную путаницу в клинической лаборатории. На сегодняшний день мало что известно о генетических взаимоотношениях таких организмов с классическими изолятами S. pneumoniae. В настоящей работе мы описываем эти взаимоотношения на основе анализа последовательностей генов хозяйства (housekeeping genes) в сравнении с ранее охарактеризованными изолятами S. pneumoniae, S. mitis и S. oralis. В то время как большинство пневмококков оказалось тесно родственным кластером, эти исследования выявили подгруппу атипичных пневмококковых изолятов (нерастворимых в желчи и/или «безкапсульных»), которая отличается от, но наиболее близка к «типичным» пневмококковым изолятам. Однако большая доля изолятов, признанных атипичными только на основании реакции на капсулу, группировалась с типичными пневмококками, что указывает на то, что они либо утратили продукцию капсулы, либо представляют пока нераспознанные серотипы капсулы. В отличие от типичных S. pneumoniae, изоляты, фенотипически идентифицированные как S. mitis и S. oralis, включая изоляты, ранее охарактеризованные в таксономических исследованиях, оказались генетически разнообразными. В то время как большинство изолятов S. oralis образовывало четко отделенную группу, изоляты S. mitis не формировали такой отдельной кластера. В ходе этих исследований мы также выявили ряд потенциально значимых патогенных изолятов, часто ассоциированных с респираторными заболеваниями, которые фенотипически и генетически наиболее близки к S. mitis, но содержат гены, кодирующие детерминанты вирулентности — пневмолизин и аутолизин, классически ассоциируемые с S. pneumoniae.