Структура популяции Streptococcus oralis

Streptococcus oralis является представителем нормальной микробиоты полости рта человека, способным к оппортунической патогенности; как и родственные ротовые стрептококки, он обладает значительной фенотипической и генетической вариабельностью. Для S. oralis была разработана схема мультилокусного типирования последовательностей (MLST), и полученные данные проанализированы с целью изучения структуры популяции вида. Анализ 113 изолятов, подтверждённых как относящиеся к группе S. oralis/mitis по секвенированию гена 16S рРНК, охарактеризовал популяцию как высокоразнообразную и подвергающуюся меж- и внутривидовой рекомбинации с вероятной структурой клонических комплексов. Анализ ClonalFrame этих изолятов S. oralis совместно с примерами Streptococcus pneumoniae, Streptococcus mitis и Streptococcus pseudopneumoniae сгруппировал названные виды в отдельные, когерентные популяции и не подтвердил кластеризацию S. pseudopneumoniae с S. mitis, как сообщалось ранее при использовании методов на основе расстояний. Анализ отдельных локусов позволил предположить, что это расхождение связано с возможной гибридной природой S. pseudopneumoniae. Данные доступны на общественном сайте MLST (http://pubmlst.org/soralis/).