Насколько информативна мышь для исследований микробиоты кишечника человека?

Микробиота кишечника человека привлекает всё большее внимание в связи с её ассоциацией с широким кругом заболеваний — от метаболических расстройств (например, ожирение и диабет 2 типа) до аутоиммунных заболеваний (таких как воспалительные заболевания кишечника и диабет 1 типа), рака и даже нарушений нейроразвития (например, аутизм). Мыши всё чаще используются в биомедицинских исследованиях и стали моделью выбора для большинства работ в этой развивающейся области. Мышиные модели позволяют изучать возмущения в составе кишечной микробиоты в контролируемой экспериментальной обстановке, что помогает оценивать причинно-следственные связи в сложных взаимодействиях хозяин–микробиота и разрабатывать механистические гипотезы. Однако при переносе результатов исследований микробиома кишечника с мышиных моделей на человека следует учитывать подводные камни. В этой обзорной статье мы обсуждаем внутренние сходства и различия между двумя системами и сравниваем ядро кишечной микробиоты человека и мыши на основе метаанализа доступных в настоящее время наборов данных. Наконец, мы рассматриваем внешние факторы, влияющие на способность мышиных моделей воспроизводить сдвиги в микробиоте кишечника, связанные с заболеваниями человека, и исследуем, какие альтернативные модельные системы существуют для исследований микробиоты кишечника.