Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека

Catherine Lozupone; Rob Knight; Jason Miller; Sergey Koren; Mathangi Thiagarajan; Sarah Young; Qiandong Zeng; Jennifer R. Wortman; Bruce W. Birren; William Nelson; Todd Z. DeSantis; Gary L. Andersen; Scott T. Kelley; Dan Knights; Ruth E. Ley; Daniel McDonald; R. C. Edgar; Victor Markowitz; Konstantinos Mavromatis; I-Min A. Chen; Ken Chu; Nikos C. Kyrpides; Brian J. Haas; José C. Clemente; Katherine S. Pollard; Barbara A. Methé; Konstantinos Liolios; Krishna Palaniappan; Patrick D. Schloss; Curtis Huttenhower; Nicola Segata; Janet Jansson; Jacques Izard; Dirk Gevers; Eric J. Alm; Antonio González; Todd J. Treangen; Martin J. Blaser; Sahar Abubucker; Jonathan H. Badger; Chien‐Chi Lo; Patrick Chain; Bo Liu; Richard A. Gibbs; Richard K. Wilson; Lucinda Fulton; Robert S. Fulton; Elaine R. Mardis; Yuanqing Wu; Lei Chen; Carsten Russ; Kristine M. Wylie; Jack D. Sobel; George M. Weinstock; Erica Sodergren; Georgia Giannoukos; Chad Nusbaum; Christie Kovar; Donna M. Muzny; Ramana Madupu; Heidi H. Kong; Jeffery A. Schloss; Peter Mannon; Jonathan Crabtree; Owen White; Joshua Orvis; Jamison McCorrison; Indresh Singh; Asif Chinwalla; Patrick Minx; Sandra W. Clifton; Donna M. Muzny; Kim C. Worley; Kris A. Wetterstrand; Jeroen Raes; Thomas M. Schmidt; Kevin Riehle; Mihai Pop; Wesley C. Warren; Sarah Young; John C. Martin; Omry Koren; Floyd E. Dewhirst; Heather H. Creasy; Ashlee M. Earl; Michael G. FitzGerald; Michelle Giglio; Kymberlie Hallsworth-Pepin; Elizabeth A. Lobos; Vincent Magrini; John Martin; Makedonka Mitreva; James Versalovic; Aye Wollam; Kjersti M. Aagaard; Olukemi O. Abolude; Emma Allen‐Vercoe; Lucia Alvarado; Scott Anderson; Elizabeth L. Appelbaum; Harindra Arachchi; Gary C. Armitage; Cesar Arze; Tulin Ayvaz; Carl C. Baker; Lisa Begg; Tsegahiwot Belachew; Veena Bhonagiri; Monika Bihan; Toby Bloom; Vivien Bonazzi; J. Paul Brooks; Gregory A. Buck; Christian Buhay; Dana Busam; Joseph L. Campbell; Shane R. Canon; Brandi L. Cantarel; I.-Min A. Chen; Shaila Chhibba; Dawn Ciulla; Sean Conlan; Jonathan Crabtree; Mary A. Cutting; Noam J. Davidovics; Catherine Davis; Carolyn Deal; Kimberley D. Delehaunty; Elena Deych; Yan Ding; David J. Dooling; Shannon Dugan; W. Michael Dunne; A. Scott Durkin; Rachel Erlich; Candace N. Farmer; Ruth M. Farrell; Karoline Faust; Michael Feldgarden; Victor Felix; Sheila Fisher; Anthony A. Fodor; Larry J. Forney; Leslie Foster; Valentina Di Francesco; Jonathan Friedman; Dennis C. Friedrich; Catrina C. Fronick; Hongyu Gao; M. Nathalia Garcia; Christina Giblin; Maria Y. Giovanni; Jonathan M. Goldberg; Johannes B. Goll; Antonio González; Allison Griggs; Sharvari Gujja; Susan Kinder Haake; Holli Hamilton; Emily Harris; Theresa A. Hepburn; Brandi Herter; Diane E. Hoffmann; Michael Holder; Clinton Howarth; Katherine Huang; Susan M. Huse; Huaiyang Jiang; Catherine Jordan; Vandita Joshi; James A. Katancik; Wendy A. Keitel; Cristyn Kells; Nicholas B. King; Karthik Kota; Patricio S. La Rosa; Sandra L. Lee; Katherine P. Lemon; Niall J. Lennon; Cecil M. Lewis; Lora Lewis; Kelvin Li; Bo Liu; Yue Liu; Chien- Chi Lo; R. Dwayne Lunsford; Tessa Madden; Anup Mahurkar; Daniel McDonald; Jean E. McEwen; Amy L. McGuire; Pamela McInnes; Teena Mehta; Kathie A. Mihindukulasuriya; Irene Newsham; Michelle Oglaughlin; Ioanna Pagani; Shital M. Patel; M.A. Pearson; Jane Peterson; Mircea Podar; Craig Pohl; Margaret Priest; Lita M. Proctor; Xiang Qin; Jacques Ravel; Jeffrey G. Reid; Mina Rho; Rosamond Rhodes; Maria C. Rivera; Beltran Rodriguez-Mueller; Yu Hui Rogers; Matthew C. Ross; Ravi Sanka; Pamela Sankar; J. Fah Sathirapongsasuti; Matthew Scholz; Lynn M. Schriml; Alyxandria M. Schubert; Julia A. Segre; William D. Shannon; Richard R. Sharp; Thomas J. Sharpton; Narmada Shenoy; Nihar U. Sheth; Gina Simone; Christopher S. Smillie; Doron D. Sommer; Paul Spicer; Granger G. Sutton; Sean M. Sykes; Diana Tabbaa; Chad Tomlinson; Manolito Torralba; Rebecca Truty; Tatiana A. Vishnivetskaya; Jason Walker; Lu Wang; Zhengyuan Wang; Doyle V. Ward; Mark A. Watson; Matthew T. Wheeler; James R. White; Katarzyna Wilczek-Boney; Todd Wylie; Chandri Yandava; Ye Liang; Yuzhen Ye; Shibu Yooseph; Bonnie P. Youmans; Lan Zhang; Yanjiao Zhou; Yiming Zhu; Laurie Zoloth; Jeremy Zucker; Susan J. Birren; Richard A. Gibbs; Sarah K. Highlander; Joseph F. Petrosino; Mircea Podar; Thomas J. Sharpton; Rebecca M. Truty; Katherine S. Pollard; Mihai Pop; Mina Rho; Yuzhen Ye; Rosamond Rhodes; Kevin P. Riehle; Pamela Sankar; Alyxandria M. Schubert; Patrick D. Schloss; Thomas M. Schmidt; Gina A. Simone; Jack D. Sobel; Todd J. Treangen; Shibu Yooseph; Laurie Zoloth; Joseph F. Petrosino; Julia A. Segre; Sean Conlan; Owen White; Lora Lewis; Yue Liu; Michelle D. O’Laughlin; Anthony A. Fodor; Ioanna Pagani; Liang Ye; Curtis Huttenhower; Jonathan Friedman; Michelle O’Laughlin; Yu-Hui Rogers; Sarah K. Highlander; James Versalovic; Joseph L. Campbell; Christopher Wellington; Gregory A. Buck; Maria C. Rivera; Chien-Chi Lo; I-Min A. Chen; Karoline Faust; Jeroen Raes; Yu-Hui Rogers; Zhengyuan Wang; Lei Chen; A. Scott Durkin; Jane A. Peterson; Xiang Qin; Yuanqing Wu; Karen E. Nelson; Nathalia Garcia; Daniel D. Sommer; Leslie Foster; Katherine P. Lemon; Jane Peterson; Dirk Gevers; Michael Feldgarden; Brandi Herter; A. Scott Durkin; Manolito Torralba; Irene Newsham; Gary L. Andersen; Gary Armitage; Carolyn Deal; Valentina Di Francesco; Shaila Chhibba; Nihar U. Sheth; Matthew Scholz; Victor M. Markowitz; Konstantinos Mavromatis; Ken Chu; Mary A. Cutting; Nicholas B. King; Heidi H. Kong; Omry Koren; Ruth E. Ley; Cecil M. Lewis; Bruce W. Birren; Brandi Herter; Michelle O'Laughlin; M A Torralba; Karen Nelson

doi:10.1038/nature11234

Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека

Structure, function and diversity of the healthy human microbiome

Catherine Lozupone, Rob Knight, Jason Miller, Sergey Koren, Mathangi Thiagarajan, Sarah Young, Qiandong Zeng, Jennifer R. Wortman, Bruce W. Birren, William Nelson, Todd Z. DeSantis, Gary L. Andersen, Scott T. Kelley, Dan Knights, Ruth E. Ley, Daniel McDonald, R. C. Edgar, Victor Markowitz, Konstantinos Mavromatis, I-Min A. Chen, Ken Chu, Nikos C. Kyrpides, Brian J. Haas, José C. Clemente, Katherine S. Pollard, Barbara A. Methé, Konstantinos Liolios, Krishna Palaniappan, Patrick D. Schloss, Curtis Huttenhower, Nicola Segata, Janet Jansson, Jacques Izard, Dirk Gevers, Eric J. Alm, Antonio González, Todd J. Treangen, Martin J. Blaser, Sahar Abubucker, Jonathan H. Badger, Chien‐Chi Lo, Patrick Chain, Bo Liu, Richard A. Gibbs, Richard K. Wilson, Lucinda Fulton, Robert S. Fulton, Elaine R. Mardis, Yuanqing Wu, Lei Chen, Carsten Russ, Kristine M. Wylie, Jack D. Sobel, George M. Weinstock, Erica Sodergren, Georgia Giannoukos, Chad Nusbaum, Christie Kovar, Donna M. Muzny, Ramana Madupu, Heidi H. Kong, Jeffery A. Schloss, Peter Mannon, Jonathan Crabtree, Owen White, Joshua Orvis, Jamison McCorrison, Indresh Singh, Asif Chinwalla, Patrick Minx, Sandra W. Clifton, Donna M. Muzny, Kim C. Worley, Kris A. Wetterstrand, Jeroen Raes, Thomas M. Schmidt, Kevin Riehle, Mihai Pop, Wesley C. Warren, Sarah Young, John C. Martin, Omry Koren, Floyd E. Dewhirst, Heather H. Creasy, Ashlee M. Earl, Michael G. FitzGerald, Michelle Giglio, Kymberlie Hallsworth-Pepin, Elizabeth A. Lobos, Vincent Magrini, John Martin, Makedonka Mitreva, James Versalovic, Aye Wollam, Kjersti M. Aagaard, Olukemi O. Abolude, Emma Allen‐Vercoe, Lucia Alvarado, Scott Anderson, Elizabeth L. Appelbaum, Harindra Arachchi, Gary C. Armitage, Cesar Arze, Tulin Ayvaz, Carl C. Baker, Lisa Begg, Tsegahiwot Belachew, Veena Bhonagiri, Monika Bihan, Toby Bloom, Vivien Bonazzi, J. Paul Brooks, Gregory A. Buck, Christian Buhay, Dana Busam, Joseph L. Campbell, Shane R. Canon, Brandi L. Cantarel, I.-Min A. Chen, Shaila Chhibba, Dawn Ciulla, Sean Conlan, Jonathan Crabtree, Mary A. Cutting, Noam J. Davidovics, Catherine Davis, Carolyn Deal, Kimberley D. Delehaunty, Elena Deych, Yan Ding, David J. Dooling, Shannon Dugan, W. Michael Dunne, A. Scott Durkin, Rachel Erlich, Candace N. Farmer, Ruth M. Farrell, Karoline Faust, Michael Feldgarden, Victor Felix, Sheila Fisher, Anthony A. Fodor, Larry J. Forney, Leslie Foster, Valentina Di Francesco, Jonathan Friedman, Dennis C. Friedrich, Catrina C. Fronick, Hongyu Gao, M. Nathalia Garcia, Christina Giblin, Maria Y. Giovanni, Jonathan M. Goldberg, Johannes B. Goll, Antonio González, Allison Griggs, Sharvari Gujja, Susan Kinder Haake, Holli Hamilton, Emily Harris, Theresa A. Hepburn, Brandi Herter, Diane E. Hoffmann, Michael Holder, Clinton Howarth, Katherine Huang, Susan M. Huse, Huaiyang Jiang, Catherine Jordan, Vandita Joshi, James A. Katancik, Wendy A. Keitel, Cristyn Kells, Nicholas B. King, Karthik Kota, Patricio S. La Rosa, Sandra L. Lee, Katherine P. Lemon, Niall J. Lennon, Cecil M. Lewis, Lora Lewis, Kelvin Li, Bo Liu, Yue Liu, Chien- Chi Lo, R. Dwayne Lunsford, Tessa Madden, Anup Mahurkar, Daniel McDonald, Jean E. McEwen, Amy L. McGuire, Pamela McInnes, Teena Mehta, Kathie A. Mihindukulasuriya, Irene Newsham, Michelle Oglaughlin, Ioanna Pagani, Shital M. Patel, M.A. Pearson, Jane Peterson, Mircea Podar, Craig Pohl, Margaret Priest, Lita M. Proctor, Xiang Qin, Jacques Ravel, Jeffrey G. Reid, Mina Rho, Rosamond Rhodes, Maria C. Rivera, Beltran Rodriguez-Mueller, Yu Hui Rogers, Matthew C. Ross, Ravi Sanka, Pamela Sankar, J. Fah Sathirapongsasuti, Matthew Scholz, Lynn M. Schriml, Alyxandria M. Schubert, Julia A. Segre, William D. Shannon, Richard R. Sharp, Thomas J. Sharpton, Narmada Shenoy, Nihar U. Sheth, Gina Simone, Christopher S. Smillie, Doron D. Sommer, Paul Spicer, Granger G. Sutton, Sean M. Sykes, Diana Tabbaa, Chad Tomlinson, Manolito Torralba, Rebecca Truty, Tatiana A. Vishnivetskaya, Jason Walker, Lu Wang, Zhengyuan Wang, Doyle V. Ward, Mark A. Watson, Matthew T. Wheeler, James R. White, Katarzyna Wilczek-Boney, Todd Wylie, Chandri Yandava, Ye Liang, Yuzhen Ye, Shibu Yooseph, Bonnie P. Youmans, Lan Zhang, Yanjiao Zhou, Yiming Zhu, Laurie Zoloth, Jeremy Zucker, Susan J. Birren, Richard A. Gibbs, Sarah K. Highlander, Joseph F. Petrosino, Mircea Podar, Thomas J. Sharpton, Rebecca M. Truty, Katherine S. Pollard, Mihai Pop, Mina Rho, Yuzhen Ye, Rosamond Rhodes, Kevin P. Riehle, Pamela Sankar, Alyxandria M. Schubert, Patrick D. Schloss, Thomas M. Schmidt, Gina A. Simone, Jack D. Sobel, Todd J. Treangen, Shibu Yooseph, Laurie Zoloth, Joseph F. Petrosino, Julia A. Segre, Sean Conlan, Owen White, Lora Lewis, Yue Liu, Michelle D. O’Laughlin, Anthony A. Fodor, Ioanna Pagani, Liang Ye, Curtis Huttenhower, Jonathan Friedman, Michelle O’Laughlin, Yu-Hui Rogers, Sarah K. Highlander, James Versalovic, Joseph L. Campbell, Christopher Wellington, Gregory A. Buck, Maria C. Rivera, Chien-Chi Lo, I-Min A. Chen, Karoline Faust, Jeroen Raes, Yu-Hui Rogers, Zhengyuan Wang, Lei Chen, A. Scott Durkin, Jane A. Peterson, Xiang Qin, Yuanqing Wu, Karen E. Nelson, Nathalia Garcia, Daniel D. Sommer, Leslie Foster, Katherine P. Lemon, Jane Peterson, Dirk Gevers, Michael Feldgarden, Brandi Herter, A. Scott Durkin, Manolito Torralba, Irene Newsham, Gary L. Andersen, Gary Armitage, Carolyn Deal, Valentina Di Francesco, Shaila Chhibba, Nihar U. Sheth, Matthew Scholz, Victor M. Markowitz, Konstantinos Mavromatis, Ken Chu, Mary A. Cutting, Nicholas B. King, Heidi H. Kong, Omry Koren, Ruth E. Ley, Cecil M. Lewis, Bruce W. Birren, Brandi Herter, Michelle O'Laughlin, M A Torralba, Karen Nelson

2012-06-01

SCID: 54.1/xvv72aq4 Discuss with AI

Нишевая специализация мест обитанияПроект микробиома человекаМикробиом человекаМетагеномные метаболические путиСтруктура микробного сообщества

Abstract (AI)

Исследования микробиома человека показали, что даже здоровые люди существенно различаются по составу микроорганизмов, обитающих в таких локусах, как кишечник, кожа и влагалище. Значительная часть этого разнообразия остаётся необъяснённой, хотя были выявлены связи с питанием, окружающей средой, генетикой хозяина и ранним воздействием микроорганизмов. Поэтому для характеристики экологии микробных сообществ, ассоциированных с человеком, в рамках Проекта микробиома человека была проанализирована крупнейшая на тот момент когорта и наиболее широкий набор различных клинически значимых локусов тела. Было обнаружено, что разнообразие и численность характерных для каждого локуса микроорганизмов значительно варьируют даже среди здоровых участников, при этом наблюдается выраженная специализация по экологическим нишам как внутри отдельных организмов, так и между ними. Проект охватил, по оценкам, 81–99% родов, семейств ферментов и конфигураций сообществ, представленных в здоровом микробиоме западной популяции. Несмотря на вариабельность структуры сообществ, наличие метаболических путей, выявленное метагеномными методами, оставалось стабильным у разных людей, а этническая/расовая принадлежность оказалась одной из наиболее сильных характеристик, ассоциированных как с метаболическими путями, так и с микроорганизмами в клинических метаданных. Таким образом, эти результаты очерчивают диапазон нормальных структурных и функциональных конфигураций микробных сообществ здоровой популяции, создавая основу для дальнейшего изучения эпидемиологии, экологии и трансляционных применений микробиома человека. Консорциум Проекта микробиома человека представляет первые результаты анализа микробных сообществ из различных клинически значимых локусов тела в когорте людей; полученные сведения о микробных сообществах здоровой популяции закладывают основу для дальнейшего изучения эпидемиологии, экологии и трансляционных применений микробиома человека. Проект микробиома человека (HMP), поддерживаемый Общим фондом Национальных институтов здравоохранения США, направлен на характеристику микробных сообществ, населяющих организм человека и взаимодействующих с ним в состоянии здоровья и болезни. В двух статьях этого выпуска Nature HMP...

Key Findings

Этническая или расовая принадлежность была одной из наиболее сильных ассоциаций, связывающих микробные пути и таксоны с клиническими данными.

У здоровых людей наблюдались значительные различия в разнообразии и abundance характерных микробов кишечника, кожи, влагалища и других участков тела.

Набор метагеномных метаболических путей оставался относительно стабильным между людьми, несмотря на существенные различия в структуре сообществ.

Микробные сообщества демонстрировали выраженную специализацию по экологическим нишам как внутри отдельных людей, так и между людьми.

Проект «Микробиом человека» охватил примерно 81–99% родов, семейств ферментов и конфигураций сообществ, встречающихся в здоровом западном микробиоме.

Исследование определяет диапазоны структурных и функциональных конфигураций, характерных для здоровых микробных сообществ человека.

Research Object

Микробиом здорового человека (микробные сообщества, населяющие такие биотопы тела, как кишечник, кожа и влагалище)

Research Subject

Структурное и функциональное разнообразие, конфигурации сообществ, экологическая специализация ниш и стабильность метаболических путей здорового микробиома человека

Publication Details

DOI

10.1038/nature11234

Publication Date

2012-06-01

Journal

Publisher

ISSN

Open access PDF

https://www.nature.com/articles/nature11234.pdf

Access Type

Author Information

Authors

Catherine Lozupone

Rob Knight

Jason Miller

Sergey Koren

Mathangi Thiagarajan

Sarah Young

Qiandong Zeng

Jennifer R. Wortman

Bruce W. Birren

William Nelson

Todd Z. DeSantis

Gary L. Andersen

Scott T. Kelley

Dan Knights

Ruth E. Ley

Daniel McDonald

R. C. Edgar

Victor Markowitz

Konstantinos Mavromatis

I-Min A. Chen

Ken Chu

Nikos C. Kyrpides

Brian J. Haas

José C. Clemente

Katherine S. Pollard

Barbara A. Methé

Konstantinos Liolios

Krishna Palaniappan

Patrick D. Schloss

Curtis Huttenhower

Nicola Segata

Janet Jansson

Jacques Izard

Dirk Gevers

Eric J. Alm

Antonio González

Todd J. Treangen

Martin J. Blaser

Sahar Abubucker

Jonathan H. Badger

Chien‐Chi Lo

Patrick Chain

Bo Liu

Richard A. Gibbs

Richard K. Wilson

Lucinda Fulton

Robert S. Fulton

Elaine R. Mardis

Yuanqing Wu

Lei Chen

Carsten Russ

Kristine M. Wylie

Jack D. Sobel

George M. Weinstock

Erica Sodergren

Georgia Giannoukos

Chad Nusbaum

Christie Kovar

Donna M. Muzny

Ramana Madupu

Heidi H. Kong

Jeffery A. Schloss

Peter Mannon

Jonathan Crabtree

Owen White

Joshua Orvis

Jamison McCorrison

Indresh Singh

Asif Chinwalla

Patrick Minx

Sandra W. Clifton

Donna M. Muzny

Kim C. Worley

Kris A. Wetterstrand

Jeroen Raes

Thomas M. Schmidt

Kevin Riehle

Mihai Pop

Wesley C. Warren

Sarah Young

John C. Martin

Omry Koren

Floyd E. Dewhirst

Heather H. Creasy

Ashlee M. Earl

Michael G. FitzGerald

Michelle Giglio

Kymberlie Hallsworth-Pepin

Elizabeth A. Lobos

Vincent Magrini

John Martin

Makedonka Mitreva

James Versalovic

Aye Wollam

Kjersti M. Aagaard

Olukemi O. Abolude

Emma Allen‐Vercoe

Lucia Alvarado

Scott Anderson

Elizabeth L. Appelbaum

Harindra Arachchi

Gary C. Armitage

Cesar Arze

Tulin Ayvaz

Carl C. Baker

Lisa Begg

Tsegahiwot Belachew

Veena Bhonagiri

Monika Bihan

Toby Bloom

Vivien Bonazzi

J. Paul Brooks

Gregory A. Buck

Christian Buhay

Dana Busam

Joseph L. Campbell

Shane R. Canon

Brandi L. Cantarel

I.-Min A. Chen

Shaila Chhibba

Dawn Ciulla

Sean Conlan

Jonathan Crabtree

Mary A. Cutting

Noam J. Davidovics

Catherine Davis

Carolyn Deal

Kimberley D. Delehaunty

Elena Deych

Yan Ding

David J. Dooling

Shannon Dugan

W. Michael Dunne

A. Scott Durkin

Rachel Erlich

Candace N. Farmer

Ruth M. Farrell

Karoline Faust

Michael Feldgarden

Victor Felix

Sheila Fisher

Anthony A. Fodor

Larry J. Forney

Leslie Foster

Valentina Di Francesco

Jonathan Friedman

Dennis C. Friedrich

Catrina C. Fronick

Hongyu Gao

M. Nathalia Garcia

Christina Giblin

Maria Y. Giovanni

Jonathan M. Goldberg

Johannes B. Goll

Antonio González

Allison Griggs

Sharvari Gujja

Susan Kinder Haake

Holli Hamilton

Emily Harris

Theresa A. Hepburn

Brandi Herter

Diane E. Hoffmann

Michael Holder

Clinton Howarth

Katherine Huang

Susan M. Huse

Huaiyang Jiang

Catherine Jordan

Vandita Joshi

James A. Katancik

Wendy A. Keitel

Cristyn Kells

Nicholas B. King

Karthik Kota

Patricio S. La Rosa

Sandra L. Lee

Katherine P. Lemon

Niall J. Lennon

Cecil M. Lewis

Lora Lewis

Kelvin Li

Bo Liu

Yue Liu

Chien- Chi Lo

R. Dwayne Lunsford

Tessa Madden

Anup Mahurkar

Daniel McDonald

Jean E. McEwen

Amy L. McGuire

Pamela McInnes

Teena Mehta

Kathie A. Mihindukulasuriya

Irene Newsham

Michelle Oglaughlin

Ioanna Pagani

Shital M. Patel

M.A. Pearson

Jane Peterson

Mircea Podar

Craig Pohl

Margaret Priest

Lita M. Proctor

Xiang Qin

Jacques Ravel

Jeffrey G. Reid

Mina Rho

Rosamond Rhodes

Maria C. Rivera

Beltran Rodriguez-Mueller

Yu Hui Rogers

Matthew C. Ross

Ravi Sanka

Pamela Sankar

J. Fah Sathirapongsasuti

Matthew Scholz

Lynn M. Schriml

Alyxandria M. Schubert

Julia A. Segre

William D. Shannon

Richard R. Sharp

Thomas J. Sharpton

Narmada Shenoy

Nihar U. Sheth

Gina Simone

Christopher S. Smillie

Doron D. Sommer

Paul Spicer

Granger G. Sutton

Sean M. Sykes

Diana Tabbaa

Chad Tomlinson

Manolito Torralba

Rebecca Truty

Tatiana A. Vishnivetskaya

Jason Walker

Lu Wang

Zhengyuan Wang

Doyle V. Ward

Mark A. Watson

Matthew T. Wheeler

James R. White

Katarzyna Wilczek-Boney

Todd Wylie

Chandri Yandava

Ye Liang

Yuzhen Ye

Shibu Yooseph

Bonnie P. Youmans

Lan Zhang

Yanjiao Zhou

Yiming Zhu

Laurie Zoloth

Jeremy Zucker

Susan J. Birren

Richard A. Gibbs

Sarah K. Highlander

Joseph F. Petrosino

Mircea Podar

Thomas J. Sharpton

Rebecca M. Truty

Katherine S. Pollard

Mihai Pop

Mina Rho

Yuzhen Ye

Rosamond Rhodes

Kevin P. Riehle

Pamela Sankar

Alyxandria M. Schubert

Patrick D. Schloss

Thomas M. Schmidt

Gina A. Simone

Jack D. Sobel

Todd J. Treangen

Shibu Yooseph

Laurie Zoloth

Joseph F. Petrosino

Julia A. Segre

Sean Conlan

Owen White

Lora Lewis

Yue Liu

Michelle D. O’Laughlin

Anthony A. Fodor

Ioanna Pagani

Liang Ye

Curtis Huttenhower

Jonathan Friedman

Michelle O’Laughlin

Yu-Hui Rogers

Sarah K. Highlander

James Versalovic

Joseph L. Campbell

Christopher Wellington

Gregory A. Buck

Maria C. Rivera

Chien-Chi Lo

I-Min A. Chen

Karoline Faust

Jeroen Raes

Yu-Hui Rogers

Zhengyuan Wang

Lei Chen

A. Scott Durkin

Jane A. Peterson

Xiang Qin

Yuanqing Wu

Karen E. Nelson

Nathalia Garcia

Daniel D. Sommer

Leslie Foster

Katherine P. Lemon

Jane Peterson

Dirk Gevers

Michael Feldgarden

Brandi Herter

A. Scott Durkin

Manolito Torralba

Irene Newsham

Gary L. Andersen

Gary Armitage

Carolyn Deal

Valentina Di Francesco

Shaila Chhibba

Nihar U. Sheth

Matthew Scholz

Victor M. Markowitz

Konstantinos Mavromatis

Ken Chu

Mary A. Cutting

Nicholas B. King

Heidi H. Kong

Omry Koren

Ruth E. Ley

Cecil M. Lewis

Bruce W. Birren

Brandi Herter

Michelle O'Laughlin

M A Torralba

Karen Nelson

Download PDF

Make a presentation

Источники этой статьи в scid.ai4

Взаимоотношения совместного встречаемости микроорганизмов в микробиоме человека2012 Состав бактериального микробиома пищеварительного тракта у взрослых на основе образцов с семи поверхностей рта, миндалин, глотки и стула2012 Рамки исследований человеческого микробиома2012 Молекулярная идентификация бактерий, ассоциированных с бактериальным вагинозом2005

Работы, цитирующие эту статью20

Новая эра в здравоохранении: интеграция искусственного интеллекта и микробиологии2024 Функциональные архетипы в микробиоме кишечника человека выявляют метаболическое разнообразие, стабильность и влияние на сигнатуры, связанные с заболеваниями2025 Нарушение синергии Streptococcus mutans и Candida albicans комменсальным стрептококком2020 Ось «микробиота — кишечник — мозг»2019 Интегративный проект по изучению микробиома человека2019 Новый геномный атлас микробиоты кишечника человека2019 Временное развитие микробиоты кишечника в раннем детстве по данным исследования TEDDY2018 Иммунный ответ на бактерии Prevotella при хронических воспалительных заболеваниях2017 VSEARCH: универсальный открытый инструмент для метагеномики2016 Mash: быстрое оценивание расстояний между геномами и метагеномами с использованием MinHash2016 Здоровая микробиота человека2016 Биогеография микробиоты полости рта человека на микронном уровне2016 Насколько информативна мышь для исследований микробиоты кишечника человека?2015 Роль нормальной кишечной микробиоты2015 Влияние диеты и образа жизни на кишечную микробиоту и здоровье человека2014 Кишечный микробиом в раннем возрасте: здоровье и болезни2014 Влияние разнообразия бактериальной флоры кишечного тракта на смертность после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток2014 Kraken: сверхбыстрая классификация метагеномных последовательностей с использованием точных выравниваний2014 phyloseq: пакет R для воспроизводимого интерактивного анализа и визуализации данных о составе микробиома2013 Животные в бактериальном мире: новый императив для наук о жизни2013