Филогенетическое сравнение и классификация белковых последовательностей лакказ и родственных им мультикупровых оксидаз

Филогенетический анализ более 350 мультикупровых оксидаз (MCO) грибов, насекомых, растений и бактерий послужил основой для уточнённой классификации этого семейства ферментов на лакказы sensu stricto (базидиомицетные и аскомицетные), лакказы насекомых, грибные пигментные MCO, грибные ферроксидазы, аскорбатоксидазы, растительные MCO, подобные лакказам, и билирубиноксидазы. В крупнейшей группе ферментов, образованной 125 базидиомицетными лакказами, филогения генов не вполне соответствует филогении видов. По-видимому, ферменты группируются, по крайней мере частично, в соответствии с образом жизни соответствующих видов. Анализ полностью секвенированных геномов грибов показал, что состав MCO у разных видов может значительно различаться. Некоторые виды, по-видимому, кодируют только ферроксидазы, тогда как у других имеются белки, распределённые по четырём различным функциональным кластерам филогенетического дерева.