Признаки негативного отбора в генетической архитектуре сложных признаков человека

Мы разработали байесовскую смешанную линейную модель, которая одновременно оценивает наследуемость, основанную на однонуклеотидных полиморфизмах (SNP), поли Генетичность (долю SNP с ненулевыми эффектами) и зависимость между величиной эффекта SNP и частотой минорного аллеля для сложных признаков у условно несвязанных индивидуумов, используя геномные данные по SNP. Мы применили метод к 28 сложным признакам в данных UK Biobank (N = 126 752) и показали, что в среднем 6% SNP имеют ненулевые эффекты, которые в сумме объясняют 22% фенотипической дисперсии. Мы обнаружили значимые (P < 0.05/28) признаки естественного отбора в генетической архитектуре 23 признаков, включая репродуктивные, сердечно-сосудистые и антропометрические признаки, а также уровень образования. Значимые оценки зависимости между величиной эффекта и частотой минорного аллеля для сложных признаков согласуются с моделью негативного (очищающего) отбора, что подтверждается прямой (forward) симуляцией. Мы заключаем, что негативный отбор повсеместно действует на генетические варианты, связанные с человеческими сложными признаками. BayesS оценивает наследуемость на основе SNP, поли Генетичность и зависимость между величиной эффекта и частотой минорного аллеля, используя геномные данные по SNP. Применение BayesS к данным UK Biobank выявляет признаки естественного отбора для 23 сложных признаков.