Структура популяции и собственный анализ

Существующие методы вывода структуры популяции по генетическим данным не предоставляют формальных тестов значимости для популяционной дифференциации. Мы рассматриваем подход к изучению структуры популяции (анализ главных компонент), который впервые был применён к генетическим данным Кавалли-Сфорца и коллегами. Мы обосновываем метод с точки зрения современной статистики, используя результаты современной теории статистики для разработки формальных тестов значимости. Мы также выявляем общее явление «фазового перехода» в способности обнаруживать структуру в генетических данных, которое вытекает из используемой статистической теории и имеет важное следствие для обнаружения структуры: для фиксированного, но большого размера набора данных различие между двумя популяциями (измеряемое, например, статистикой вроде FST) ниже некоторого порога по сути необнаружимо, тогда как немного выше порога обнаружение становится простым. Это означает, что мы можем предсказать необходимый размер набора данных для обнаружения структуры.