Интрогрессия гаплотипов восточно-китайского и южно-китайского происхождения способствует улучшению фертильности и иммунитета у современных европейских свиней
Introgression of Eastern Chinese and Southern Chinese haplotypes contributes to the improvement of fertility and immunity in European modern pigs
2020-03-01
SCID: 54.1/s4e4g552
Discuss with AI
локус AHRгаплотипы восточно-китайских свиней (ECN)французский Large White (FLW)гаплотипы южно-китайских свиней (SCN)интрогрессия
Figures from the paper
Abstract (AI)
ФОН: Свиней одомашнивали независимо от европейских и азиатских диких кабанов примерно 10 000 лет назад. Китайские аборигенные породы исторически вводились для улучшения местных европейских свиней. Однако географическое происхождение и биологические функции интрогрессированных китайских генов в современных европейских породах свиней остаются в значительной степени неизвестными. РЕЗУЛЬТАТЫ: В настоящем исследовании мы проанализировали данные полного геномного секвенирования 266 эврoазийских диких кабанов и домашних свиней, чтобы составить детальную карту интрогрессии между французской породой Large White (FLW) и китайскими свиньями. Мы показали, что у FLW наблюдалась историческая адмиксия с южно-китайскими (SCN) и восточно-китайскими (ECN) свиньями примерно 200–300 лет назад. Более того, ряд SCN-гаплотипов оказался полезным для повышения устойчивости к заболеваниям, тогда как ECN-гаплотипы благоприятствуют улучшению репродуктивных показателей у FLW. Дополнительно мы подтверждаем антропогенно опосредованные интрогрессии в локусе AHR, где гаплотип, наиболее вероятно происходящий из ECN, способствует повышенной фертильности у FLW. ВЫВОДЫ: Это исследование углубляет понимание истории селекции глобальных домашних свиней и подчеркивает важность искусственной интрогрессии в формировании фенотипических признаков у домашних животных.
Key Findings
1
Искусственная, обусловленная человеком интрогрессия от китайских свиней сыграла ключевую роль в формировании фенотипических признаков современных европейских домашних свиней.
2
Французские свиньи породы Large White (FLW) подверглись историческому смешению с южно-китайскими (SCN) и восточно-китайскими (ECN) свиньями примерно 200–300 лет назад.
3
Интегрированные ECN-гаплотипы в FLW связаны с улучшенной репродуктивной способностью (повышенная фертильность).
4
Интегрированные SCN-гаплотипы в FLW связаны с улучшенной сопротивляемостью заболеваниям (усиленный иммунитет).
5
Локус AHR у FLW содержит гаплотип, вероятно происходящий от ECN, который способствует повышенной фертильности.
Research Object
Интrogрессированные китайские гаплотипы (восточно-китайские и южно-китайские) в европейских современных свиньях (French Large White)
Research Subject
Влияние интрогрессированных восточно-китайских (ECN) и южно-китайских (SCN) гаплотипов на фертильность и устойчивость к заболеваниям у европейских современных свиней, включая вклад специфического локуса AHR в повышение фертильности
Publication Details
Publication Date
2020-03-01
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest
Источники этой статьи в scid.ai3
PLINK второго поколения: ответ на вызов, связанный с увеличением объёма и богатства наборов данных2015
Статистическая структура для выявления SNP, обнаружения мутаций, картирования ассоциаций и оценки популяционных генетических параметров по данным секвенирования2011
Инструментарий анализа генома: фреймворк MapReduce для анализа данных секвенирования ДНК нового поколения2010