DnaSP v5: программное обеспечение для всестороннего анализа данных о полиморфизме ДНК
DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data
2009-04-03
SCID: 54.1/u3fd3dca
Discuss with AI
анализ полиморфизма ДНКгеномный браузер UCSCфазирование гаплотиповполиморфизм вставок/делецийанализ скользящего окна
Figures from the paper
Abstract (AI)
ОБОСНОВАНИЕ: DnaSP представляет собой программный пакет для всестороннего анализа данных о полиморфизме ДНК. В версии 5 реализован ряд новых функций и аналитических методов, позволяющих проводить расширенный анализ полиморфизма ДНК на больших наборах данных. Среди прочих возможностей новые методы обеспечивают: (i) анализ нескольких файлов данных; (ii) фазирование гаплотипов; (iii) анализ данных о полиморфизме вставок/делеций; и (iv) визуализацию результатов анализа скользящего окна с интеграцией доступных аннотаций генома в браузере UCSC. ДОСТУПНОСТЬ: Свободно доступно академическим пользователям по адресу http://www.ub.edu/dnasp.
Key Findings
1
В DnaSP v5 реализованы фазирование гаплотипов и анализ данных о полиморфизме вставок и делеций.
2
DnaSP версии 5 обеспечивает комплексный анализ полиморфизма ДНК и поддерживает масштабный анализ больших наборов данных.
3
Результаты анализа скользящим окном можно визуализировать вместе с аннотациями генома благодаря интеграции с браузером UCSC.
4
Программа поддерживает анализ нескольких файлов данных, что позволяет проводить более широкие сравнительные исследования полиморфизма ДНК.
5
Программа бесплатно доступна академическим пользователям.
Research Object
данные о полиморфизме ДНК
Research Subject
комплексный анализ полиморфизма ДНК, включая анализ нескольких файлов данных, фазирование гаплотипов, полиморфизмов вставок/делеций и результатов анализа скользящим окном, интегрированных с аннотациями генома
Publication Details
Publication Date
2009-04-03
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest