Геномная последовательность палеополиплоидной сои

Соя (Glycine max) — одна из важнейших сельскохозяйственных культур, ценная благодаря содержанию белка и масла в семенах, а также способности фиксировать атмосферный азот посредством симбиоза с почвенными микроорганизмами. Геном размером 1,1 гигабазы был секвенирован методом полногеномного дробовикового секвенирования и интегрирован с физической и высокоплотной генетическими картами для создания черновой сборки последовательности хромосомного уровня. Мы предсказываем наличие 46 430 белок-кодирующих генов — на 70% больше, чем у Arabidopsis, и примерно столько же, сколько в геноме тополя, который, подобно сое, является древним полиплоидом (палеополиплоидом). Около 78% предсказанных генов расположено на концах хромосом, составляющих менее половины генома, но обеспечивающих почти всю генетическую рекомбинацию. Дупликации генома произошли приблизительно 59 и 13 миллионов лет назад, в результате чего сформировался геном с высокой степенью дупликации: почти 75% генов представлены несколькими копиями. За двумя событиями дупликации последовали диверсификация и утрата генов, а также многочисленные хромосомные перестройки. Точная последовательность генома сои облегчит выявление генетической основы многих признаков этой культуры и ускорит создание улучшенных сортов сои. Соя (Glycine max) — важная коммерческая культура, обеспечивающая получение белка и масла, а её симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями делают её прибыльной культурой в севооборотах. Её геном уже секвенирован: это первый секвенированный геном бобовых и, имея размер 1,1 гигабазы, крупнейший геном растения, секвенированный методом полногеномного дробовикового секвенирования. Генетическая история сои отличается многочисленными событиями: дупликации генома произошли 59 и 13 миллионов лет назад, в результате чего сформировался геном с высокой степенью дупликации, где почти 75% генов представлены несколькими копиями. Точная последовательность генома сои должна ускорить создание улучшенных сортов. Соя — важная сельскохозяйственная культура, обеспечивающая белок и масло в семенах и фиксирующая атмосферный азот посредством симбиоза с почвенными микроорганизмами. Методом полногеномного дробовикового секвенирования был секвенирован геном размером 1,1 гигабазы, а затем интегрирован с физической и высокоплотной генетическими картами для создания черновой сборки хромосомного уровня. Мы предсказываем наличие 46 430 белок-кодирующих генов — на 70% больше, чем у Arabidopsis, и примерно столько же, сколько в геноме тополя, который, подобно сое, является древним полиплоидом (палеополиплоидом). Около 78% предсказанных генов расположено на концах хромосом, составляющих менее половины генома, но обеспечивающих почти всю генетическую рекомбинацию. Дупликации генома произошли приблизительно 59 и 13 миллионов лет назад, в результате чего сформировался геном с высокой степенью дупликации, в котором почти 75% генов представлены несколькими копиями. За этими событиями последовали диверсификация и утрата генов, а также многочисленные хромосомные перестройки. Точная последовательность генома сои облегчит выявление генетической основы многих признаков этой культуры и ускорит создание улучшенных сортов сои.