Геномное и транскриптомное профилирование выявляет молекулярные характеристики карциномы околощитовидных желез

Геномное и транскриптомное профилирование расширило возможности диагностики и лечения многих видов рака. Однако молекулярные характеристики рака околощитовидных желез остаются практически неизученными, что ограничивает разработку новых терапевтических вмешательств. В настоящем исследовании мы провели геномное и транскриптомное секвенирование 50 образцов ткани околощитовидных желез (12 карцином, 28 аденом и 10 образцов нормальной ткани), чтобы изучить внутренние и сравнительные молекулярные особенности карциномы околощитовидных желез. Мы подтвердили наличие множественных мутационных паттернов по типу «двух ударов» в гене cell division cycle 73 (CDC73), приводящих к биаллельной инактивации, что ставит под сомнение наличие второго поражения в других генах. Кроме того, аллель-специфическое подавление CDC73 в копиях с герминальными усечёнными вариантами указывало на действие селективного давления до начала канцерогенеза. Транскриптомный анализ выявил повышенную экспрессию генов-мишеней E2F, активацию сигнальных путей KRAS и TNF-альфа, а также путей эпителиально-мезенхимального перехода в карциномах по сравнению с аденомами и нормальными тканями. Модель молекулярной классификации, основанная на генах, специфичных для карцином, чётко разделяла карциномы, аденомы и нормальные ткани; её клиническая применимость была продемонстрирована у двух пациентов с неопределённым злокачественным потенциалом. Более глубокий анализ экспрессии генов и функциональное прогнозирование показали, что белок 1 опухоли Вильмса (WT1) может служить потенциальным биомаркером карциномы околощитовидных желез с мутацией CDC73, что было дополнительно подтверждено методом иммуногистохимии. В целом наше исследование выявило геномные и транскриптомные профили карциномы околощитовидных желез и может способствовать дальнейшему совершенствованию прецизионной диагностики и терапии.