Соображения по поиску эпистаза

Considerations in the search for epistasis
Marleen Balvert, Johnathan Cooper‐Knock, Julian Stamp, Ross P. Byrne, Soufiane Mourragui, Juami H. M. van Gils, Stefania Benónísdóttir, Johannes Schlüter, Kevin P. Kenna, Sanne Abeln, Alfredo Iacoangeli, Joséphine T. Daub, Brian L. Browning, Gizem Taş, Jiajing Hu, Yan Wang, Elham Alhathli, Calum Harvey, Luna Pianesi, Sara C. Schulte, Jorge González-Domínguez, Erik Garrisson, Ammar Al‐Chalabi, Jorge Avila Cartes, Jasmijn A. Baaijens, Joanna von Berg, Davide Bolognini, Paola Bonizzoni, Andrea Guarracino, Mehmet Koyutürk, Magda Markowska, Raghuram Dandinasivara, Jasper van Bemmelen, Sebastian Vorbrugg, Sai Zhang, Bogdan Pasanuic, M Snyder, Alexander Schönhuth, Letitia M.F. Sng, Natalie A. Twine, Natalie A. Twine, Lorentz workshop on epistasis, Johannes Schlüter, Joanna von Berg
2024-11-19

аддитивная модель наследуемостиэпистазгенетические взаимодействиянедостающая наследуемостьоднонуклеотидный полиморфизм
Эпистаз — это изменение влияния единицы генетической информации, такой как однонуклеотидный полиморфизм или ген, на фенотип в зависимости от контекста других генетических единиц. Такие взаимодействия биологически правдоподобны и являются перспективными кандидатами для объяснения наблюдений, которые не получают полного объяснения в рамках аддитивной модели наследуемости. Однако поиск эпистаза до сих пор в значительной степени не позволил объяснить эту «недостающую наследуемость». Мы выявляем ключевые проблемы и предлагаем, чтобы в будущих исследованиях для направления поиска новых взаимодействий использовались идеализированные системы, известные биологические закономерности и даже ранее выявленные эпистатические взаимодействия.
1
Несмотря на биологическую правдоподобность, поиск эпистаза в значительной степени не смог объяснить недостающую наследуемость.
2
Эпистаз описывает зависимые от генетического контекста эффекты, которые могут объяснить фенотипическую вариативность сверх аддитивных моделей наследуемости.
3
Будущие поиски следует направлять с помощью идеализированных систем, известных биологических механизмов и ранее выявленных эпистатических взаимодействий.
4
Надёжному выявлению эпистатических взаимодействий в генетических исследованиях препятствуют серьёзные методологические трудности.

эпистатические взаимодействия между генетическими единицами, включая однонуклеотидные полиморфизмы и гены

проблемы и руководящие принципы поиска эпистаза для объяснения недостающей наследуемости

Publication Details
Publication Date
2024-11-19
Journal
Publisher
ISSN
Cited by
18
Access Type
Author Information
Authors
Marleen Balvert
Johnathan Cooper‐Knock
Julian Stamp
Ross P. Byrne
Soufiane Mourragui
Juami H. M. van Gils
Stefania Benónísdóttir
Johannes Schlüter
Kevin P. Kenna
Sanne Abeln
Alfredo Iacoangeli
Joséphine T. Daub
Brian L. Browning
Gizem Taş
Jiajing Hu
Yan Wang
Elham Alhathli
Calum Harvey
Luna Pianesi
Sara C. Schulte
Jorge González-Domínguez
Erik Garrisson
Ammar Al‐Chalabi
Jorge Avila Cartes
Jasmijn A. Baaijens
Joanna von Berg
Davide Bolognini
Paola Bonizzoni
Andrea Guarracino
Mehmet Koyutürk
Magda Markowska
Raghuram Dandinasivara
Jasper van Bemmelen
Sebastian Vorbrugg
Sai Zhang
Bogdan Pasanuic
M Snyder
Alexander Schönhuth
Letitia M.F. Sng
Natalie A. Twine
Natalie A. Twine
Lorentz workshop on epistasis
Johannes Schlüter
Joanna von Berg
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%