Сравнение простых потенциальных функций для моделирования жидкой воды
Comparison of simple potential functions for simulating liquid water
1983-07-15
SCID: 54.1/eb5f4azh
Discuss with AI
SPCTIP4Pмежмолекулярные потенциальные функциимоделирование жидкой водыфункции структурных факторо по нейтронному рассеянию
Figures from the paper
Abstract (AI)
Проведены классические монтекарловские симуляции жидкой воды в ансамбле NPT при 25 °C и 1 атм с использованием шести простых межмолекулярных потенциальных функций для димера воды: Bernal–Fowler (BF), SPC, ST2, TIPS2, TIP3P и TIP4P. Проведено сравнение с экспериментальными термодинамическими и структурными данными, включая результаты нейтронного дифракционного анализа Thiessen и Narten. Вычисленные плотности и потенциальные энергии в целом согласуются с экспериментом, за исключением оригинальной модели BF, которая даёт завышение плотности на 18% и даёт плохие структурные результаты. Потенциалы TIPS2 и TIP4P обеспечивают функции частичных структур кислород–кислород в хорошем соответствии с данными нейтронной дифракции. Согласие с экспериментальными функциями частичных структур OH и HH хуже; однако вычисленные результаты для этих функций схожи для всех потенциальных функций, поэтому расхождение может быть вызвано поправочными терминами, применяемыми при обработке нейтронных данных, или эффектом, который повсеместно не учитывается в расчётах. Приведены также сравнения коэффициентов само diffusion, полученных из молекулярно-динамических симуляций. В целом модели SPC, ST2, TIPS2 и TIP4P дают разумные структурные и термодинамические описания жидкой воды и должны быть полезны при моделировании водных растворов. Простота функций SPC, TIPS2 и TIP4P также привлекательна с вычислительной точки зрения.
Key Findings
1
Для всех моделей отмечено худшее соответствие экспериментальным OH и HH частичным структурным функциям, при этом вычисленные результаты схожи для всех потенциалов, что указывает на возможные экспериментальные корректирующие члены или единообразно неучтённый вычислительный эффект.
2
Классические NPT Монте-Карло моделирования при 25 °C и 1 атм были выполнены для шести простых потенциалов воды: BF, SPC, ST2, TIPS2, TIP3P, TIP4P.
3
Вычисленные плотности и потенциальные энергии в целом согласуются с экспериментом для всех моделей, кроме оригинальной BF, которая завышает плотность на 18% и даёт плохие структурные результаты.
4
SPC, ST2, TIPS2 и TIP4P дают разумное структурное и термодинамическое описание и рекомендованы для симуляций в водных средах; SPC, TIPS2 и TIP4P привлекательны вычислительно из‑за простоты.
5
TIPS2 и TIP4P хорошо воспроизводят кислород–кислородные частичные структурные функции в согласии с недавними результатами нейтронного дифракционного эксперимента (Thiessen и Narten).
Research Object
Жидкая вода, смоделированная простыми межмолекулярными потенциалами (BF, SPC, ST2, TIPS2, TIP3P, TIP4P)
Research Subject
Сравнение структурных, термодинамических и динамических свойств (плотность, потенциальная энергия, частичные функции структуры OO/OH/HH и коэффициенты самодиффузии), предсказанных простыми модельными потенциалами воды, с экспериментальными данными
Publication Details
Publication Date
1983-07-15
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest
Работы, цитирующие эту статью3
Прогнозирование белковых мишеней ресвератрола: биоинформатический анализ2023
Жёсткость против активности: дизайн аналогов грамицидина S против мультирезистентных бактерий на основе молекулярного проектирования2025
Фотоэкситация вызывает перемещение общего флуоресцентного зонда pH и переноса протонов, заключённого в обратных мицеллах2026