Кристаллическая структура лакказы аскомицетного гриба Thielavia arenaria — общие структурные особенности аско-лакказ
Crystal structure of an ascomycete fungal laccase from Thielavia arenaria – common structural features of asco‐laccases
2011-04-29
SCID: 54.1/nqzrs4tu
Discuss with AI
C-концевой блокирующий фрагментлакказа Thielavia arenariaасколаказыкристаллическая структуратринуклеарный медный центр
Figures from the paper
Abstract (AI)
Лакказы представляют собой медьсодержащие ферменты, используемые в различных областях, например для отбеливания текстиля. Известно несколько кристаллических структур лакказ грибов и бактерий, однако лакказы грибов-аскомицетов (аско-лакказы) остаются недостаточно изученными; на сегодняшний день опубликована только кристаллическая структура лакказы Melanocarpus albomyces (MaL). Нами определена кристаллическая структура другой аско-лакказы — лакказы из Thielavia arenaria (TaLcc1) — с разрешением 2,5 Å. Петли вблизи меди T1, формирующие карманы связывания субстрата у двух аско-лакказ, в некоторой степени различаются и включают аминокислотный остаток, предположительно участвующий в каталитическом переносе протона: в TaLcc1 это Asp, а в MaL — Glu. Кроме того, в кристаллической структуре TaLcc1 отсутствует хлорид, связанный с медью T2, который наблюдается в кристаллической структуре MaL. Уникальная особенность TaLcc1 и MaL по сравнению со структурами других лакказ заключается в том, что в обеих структурах процессированный C-конец блокирует растворительный канал T3, ведущий к триядерному центру, что указывает на общую функциональную роль этой консервативной «C-концевой пробки». Мы предполагаем, что аско-лакказы используют карбоксильную группу C-конца в процессах переноса протона, как это было предложено для Glu498 лакказы CotA из Bacillus subtilis. Кристаллическая структура TaLcc1 также демонстрирует образование сходного слабого гомодимера, наблюдаемого у MaL, который может определять свойства этих аско-лакказ при высоких концентрациях белка.
Key Findings
1
У обеих аско-лакказ процессированный C-конец блокирует растворительный канал T3, что указывает на его консервативную функциональную роль как C-концевой пробки.
2
У TaLcc1 и лакказы Melanocarpus albomyces различаются петли субстрат-связывающих карманов у меди T1 и остатки, участвующие в переносе протона: Asp у TaLcc1 и Glu у MaL.
3
Аско-лакказы могут использовать карбоксильную группу C-конца в процессах переноса протона; обе образуют слабые гомодимеры, способные влиять на их свойства при высоких концентрациях белка.
4
Кристаллическая структура аскомицетной лакказы TaLcc1 из Thielavia arenaria была определена с разрешением 2,5 Å.
5
В отличие от MaL, в кристаллической структуре TaLcc1 отсутствует хлоридный ион, связанный с медью T2.
Research Object
Аскомицетная грибная лакказа TaLcc1 из Thielavia arenaria, включая её кристаллическую структуру и состояние слабого гомодимера
Research Subject
Структурные особенности и функциональные следствия для TaLcc1, включая архитектуру медных центров, петли связывания субстрата, остатки, участвующие в переносе протонов, блокированный растворительный канал T3, консервативную C-концевую пробку и образование слабого гомодимера
Publication Details
Publication Date
2011-04-29
Journal
Publisher
ISSN
Open access PDF
Access Type
Author Information
Download PDF
Subscribe to digest