Кристаллическая структура лакказы аскомицетного гриба Thielavia arenaria — общие структурные особенности аско-лакказ

Crystal structure of an ascomycete fungal laccase from Thielavia arenaria – common structural features of asco‐laccases
Juha P. Kallio, Chiara Gasparetti, Martina Andberg, Harry Boer, Anu Koivula, Kristiina Kruus, Juha Rouvinen, Nina Hakulinen
2011-04-29

C-концевой блокирующий фрагментлакказа Thielavia arenariaасколаказыкристаллическая структуратринуклеарный медный центр
Лакказы представляют собой медьсодержащие ферменты, используемые в различных областях, например для отбеливания текстиля. Известно несколько кристаллических структур лакказ грибов и бактерий, однако лакказы грибов-аскомицетов (аско-лакказы) остаются недостаточно изученными; на сегодняшний день опубликована только кристаллическая структура лакказы Melanocarpus albomyces (MaL). Нами определена кристаллическая структура другой аско-лакказы — лакказы из Thielavia arenaria (TaLcc1) — с разрешением 2,5 Å. Петли вблизи меди T1, формирующие карманы связывания субстрата у двух аско-лакказ, в некоторой степени различаются и включают аминокислотный остаток, предположительно участвующий в каталитическом переносе протона: в TaLcc1 это Asp, а в MaL — Glu. Кроме того, в кристаллической структуре TaLcc1 отсутствует хлорид, связанный с медью T2, который наблюдается в кристаллической структуре MaL. Уникальная особенность TaLcc1 и MaL по сравнению со структурами других лакказ заключается в том, что в обеих структурах процессированный C-конец блокирует растворительный канал T3, ведущий к триядерному центру, что указывает на общую функциональную роль этой консервативной «C-концевой пробки». Мы предполагаем, что аско-лакказы используют карбоксильную группу C-конца в процессах переноса протона, как это было предложено для Glu498 лакказы CotA из Bacillus subtilis. Кристаллическая структура TaLcc1 также демонстрирует образование сходного слабого гомодимера, наблюдаемого у MaL, который может определять свойства этих аско-лакказ при высоких концентрациях белка.
1
У обеих аско-лакказ процессированный C-конец блокирует растворительный канал T3, что указывает на его консервативную функциональную роль как C-концевой пробки.
2
У TaLcc1 и лакказы Melanocarpus albomyces различаются петли субстрат-связывающих карманов у меди T1 и остатки, участвующие в переносе протона: Asp у TaLcc1 и Glu у MaL.
3
Аско-лакказы могут использовать карбоксильную группу C-конца в процессах переноса протона; обе образуют слабые гомодимеры, способные влиять на их свойства при высоких концентрациях белка.
4
Кристаллическая структура аскомицетной лакказы TaLcc1 из Thielavia arenaria была определена с разрешением 2,5 Å.
5
В отличие от MaL, в кристаллической структуре TaLcc1 отсутствует хлоридный ион, связанный с медью T2.

Аскомицетная грибная лакказа TaLcc1 из Thielavia arenaria, включая её кристаллическую структуру и состояние слабого гомодимера

Структурные особенности и функциональные следствия для TaLcc1, включая архитектуру медных центров, петли связывания субстрата, остатки, участвующие в переносе протонов, блокированный растворительный канал T3, консервативную C-концевую пробку и образование слабого гомодимера

Publication Details
Publication Date
2011-04-29
Journal
Publisher
ISSN
Access Type
Author Information
Authors
Juha P. Kallio
Chiara Gasparetti
Martina Andberg
Harry Boer
Anu Koivula
Kristiina Kruus
Juha Rouvinen
Nina Hakulinen
Explore further
Open the scid.ai AI chat with a ready-made request: it will find papers on a similar topic and help build a literature review.
Find similar papers in the chat
Make a presentation
100%